【摘 要】
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目的 运用网络药理学和细胞实验探究豆甾醇抗炎症的作用机制.方法 在TCMSP网站和SwissTargetPrediction网站预测豆甾醇作用靶点,应用GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD数据库筛选炎症相关靶点,韦恩图获取豆甾醇与炎症之间的交集靶点,STRING 11.0数据库结合Cytoscape 3.7.2软件构建交集靶点蛋白相互作用网络,使用Cytoscape 3.7.2软件的插件挖掘互作网络中的核心靶点,利用R软件进行GO和KEGG分析,使用Autodock Vina和Pymol
【机 构】
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浙江中医药大学基础医学院, 浙江 杭州310053;浙江中医药大学研究生院, 浙江 杭州310053
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目的 运用网络药理学和细胞实验探究豆甾醇抗炎症的作用机制.方法 在TCMSP网站和SwissTargetPrediction网站预测豆甾醇作用靶点,应用GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD数据库筛选炎症相关靶点,韦恩图获取豆甾醇与炎症之间的交集靶点,STRING 11.0数据库结合Cytoscape 3.7.2软件构建交集靶点蛋白相互作用网络,使用Cytoscape 3.7.2软件的插件挖掘互作网络中的核心靶点,利用R软件进行GO和KEGG分析,使用Autodock Vina和Pymol软件进行豆甾醇与核心靶点的分子对接及可视化.通过ELISA、RT-qPCR、Western blot实验验证豆甾醇对炎症细胞中细胞因子和部分关键靶点的调控作用.结果 豆甾醇与炎症共同靶点88个,核心靶点主要涉及ACHE、F2、PTGS2和MAPK3等15个;GO富集分析发现豆甾醇主要涉及对类固醇激素的反应、对营养水平的反应、类固醇激素介导的信号通路等生物学过程;KEGG分析发现豆甾醇可通过调节雌激素、内分泌抵抗和甲状腺激素等信号通路发挥抗炎作用;分子对接表明豆甾醇可以与MAPK3和PRKACA靶点紧密结合;细胞实验证实豆甾醇可干预MAPK3、PRKACA的mRNA和蛋白表达,调控细胞因子的释放,发挥抗炎作用.结论 豆甾醇可能作用于MAPK3和PRKACA等靶点调控雌激素信号通路,发挥抗炎作用.
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