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蓝藻比其它浮游植物更能适应鱼塘中常见的某些条件(如缺氮),当上层水中含氮量少时,一些蓝藻能同化大气中的氮,另一些蓝藻则能垂直移动吸收中下层营养,因此,有时能大量繁殖而形成水华.蓝藻个体大,营养价值低,难以被浮游动物滤食.蓝藻的代谢产物对水生动植物有毒.施加杀藻剂,将氮/磷比例提高到5以上、充气增氧等均可抑制蓝藻生长.