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本文采用比较研究法、文献研究法和数理统计法等研究方法，以吉林省两所高等农业院校本科专业结构作为研究对象，分析专业结构现状及出现的问题，结合实际，提出高等农业院校专业结构设置和调整应当进行足够的市场调研，从国家、社会、高校三个层面共同研究专业结构发展趋势，发挥传统专业辐射力，带动新兴交叉学科专业发展，加强专业内涵建设，建立专业结构动态调整预警机制，加强高校共同协作，共享教育资源等观点，从而促进高校办学规模、结构、质量、效益协调发展。