基于生物信息学方法分析PDCD10基因在胰腺导管腺癌中的表达水平及其与患者预后的关系

来源 :广西医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:leighttt
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 应用生物信息学方法分析程序性细胞死亡分子10(PDCD10)基因在胰腺导管腺癌中的表达水平及其与患者预后的关系。方法 搜索GEPIA数据库中关于PDCD10基因的数据,分析PDCD10基因在胰腺导管腺癌组织中的表达水平及其与患者生存情况的关系。应用UALCAN数据库分析PDCD10基因在胰腺导管腺癌组织中的甲基化水平。应用LinkedOmics数据库分析胰腺导管腺癌组织中与PDCD10基因共表达的基因,并对共表达基因进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。应用STRING网站绘制PDCD10基因的蛋白-蛋白相互作用网络图。应用TIMER数据库分析PDCD10基因表达水平与胰腺导管腺癌细胞纯度、各类型免疫细胞浸润水平的相关性。结果 胰腺导管腺癌组织中的PDCD10基因表达水平高于正常胰腺组织(P<0.05),病灶组织中PDCD10基因低表达水平的胰腺导管腺癌患者的总体生存率及无病生存率均高于组织中PDCD10基因高表达水平的患者(均P<0.05)。胰腺导管腺癌组织中PDCD10基因甲基化水平高于正常胰腺组织(P<0.05)。GO功能富集分析结果显示,与PDCD10基因共表达的基因主要参与染色体分离、染色体定位、皮肤发育、多细胞生物信号转导、突触传递、GABA能神经肌肉过程等生物学过程;KEGG通路富集分析结果显示,与PDCD10基因共表达的基因主要涉及免疫调节反应信号通路、ERBB信号通路、谷氨酸受体信号通路。与PDCD10基因编码蛋白相互作用密切的蛋白主要为STRN4、SLMAP、STRIP1等。PDCD10基因表达水平与胰腺导管癌细胞纯度无相关性(P>0.05),而与CD4+T淋巴细胞浸润水平呈负相关,与CD8+T淋巴细胞、B淋巴细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞浸润水平均呈正相关(均P<0.05)。结论 PDCD10基因在胰腺导管腺癌组织中呈高表达,其表达水平与胰腺导管腺癌患者的预后密切相关。胰腺导管腺癌的发生、发展可能与PDCD10基因甲基化水平有关,PDCD10基因或可作为胰腺导管腺癌诊断及预后评估的潜在分子标志物。
其他文献
策勒黑羊具有常年发情、繁殖率高、性成熟早等优良的繁殖特点,充分挖掘该绵羊品种优异基因,提高多胎性状是南疆绵羊种质资源保护和改良的重要途径。本研究基于基因组重测序技术筛选策勒黑羊优异的多胎性状相关候选基因,对获得的基因进行多态性分析及不同基因型与产羔数的关联分析,初步验证的基因是BMP2、POU1F1、BMPR1B、IGFBP7,ESR1;进而在转录组水平对IGFBP7、BMPR1B、ESR1进行卵
<正> 今天的计算机已经可以做许多复杂的工作,人们对它的神奇功能惊叹不已。可是,假如有人说,现在的计算机还比不上普通的小虫聪明,你会相信吗? 事实的确是这样的。计算机对数学问题的计算、对系列指令的执行,可以说毫不费力,但在联想、理性决策以及适应新环境等方面,计算机却一筹莫展,它需要别人牵着鼻子才能干活。
期刊
《寻找太阳升起的地方》是作曲家陈勇先生具有代表性的声乐作品,也是云南本土音乐创作中一首非常经典的艺术作品。笔者作为高校声乐教师,也作为该艺术歌曲的首唱者,对这首作品的演唱有一定的舞台实践经验与体会。本文将结合《寻找太阳升起的地方》的音乐特征与个人演唱分析给声乐学习者一些建议和帮助,对这首作品的演唱有更好的把握。
斯特鲁伽茨基兄弟的科幻创作历程呈现出与苏联科幻小说传统中乌托邦根源的创造性对话,潜藏着作家借科幻之外衣向人文主义问题的哲学性发问,其核心命题之一是“人与自然”关系的变化及与此相伴的“人的危机”。围绕“人与自然”的讨论隐含在斯氏兄弟包罗万象的时空构建中:他们站在60-80年代的苏联社会生活语境中眺望远处与未来,生发出关于现代与未来、苏联与世界、文学空间与现实空间的多重想象。在这些交错空间的背后,是“
作为新冠肺炎定点收治医院,在人员配置、流程管理、工作机制、体系建设等疫情防控管理工作中积累了一些实践经验,但同时也发现一些问题。通过总结医院在2022年3月新冠肺炎医疗救治工作中的经验及对疫情防控管理存在的主要问题进行梳理,提出了加强人力资源储备、优化应急流程管理、建立防控总结机制、完善应急体系建设等对策思考,以便于医院今后进一步优化整合应急管理体系,提高应急管理能力。
目的 分析某三级综合医院全年日间手术实施现状,为下一步进行相关研究提供参考和基线数据。方法 通过医院信息系统采集2019年1月1日-2019年12月31日日间手术患者病案首页数据共11 616例,剔除不适用数据,保留有效数据量11 371例;采用Excel建立数据库,对日间手术患者基本情况采用频数、率等指标进行描述性分析;对于日间手术患者费用的影响因素采用SAS 9.4统计软件进行单因素分析和回归
为筛选猪总产仔数和产活仔数性状关键SNP分子标记或候选基因,采用Illumina porcine 50K芯片对同一猪场186头加系大白猪能繁母猪开展了全基因组SNP扫描,后又对扫描结果进行了质量控制、Beagle填充和SNP基因型分型,结合这些试验猪的表型性状测定和群体结构分析结果,进行全基因组关联分析(GWAS)。群体结构分析结果表明,试验所用的加系大白猪样本未出现群体分层现象;在18对(36条
现阶段,基层医疗机构新冠疫情的防控工作重点在于做好常态化门急诊预检分诊制度及发热病人的转诊上报登记等工作、常态化落实好防院感各项防控措施,常态化做好中高风险区重点人员的随访和管理等相关工作,准确及时进行全员核酸检测和次密接人员采样管理工作,统筹做好新冠疫苗应种尽种工作,以及中高风险区人员及密切接触者的流调工作。在对疫情防控中的具体方法和措施进行复盘的过程中,其防控措施有效性和存在的问题也逐步展现。
期刊