谷氨酰胺结合蛋白的分子动力学模拟和自由能计算

来源 :化学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ffftty
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
谷氨酰胺结合蛋白(Glutamine-binding protein,GlnBp)是大肠杆菌透性酶系统中一个细胞外液底物专一性结合蛋白,对于细胞外液中谷氨酰胺(Gln)的运输和传递至关重要.本文运用分子动力学(Molecular dynamics,MD)模拟采样,考察了GlnBp关键残基与底物Gln之间的相互作用和GlnBp两条铰链的功能差别;并采用MM-PBSA方法计算了GlnBp与底物Gln的结合自由能.结果表明:Ph13,Phe50,Thr118和Ile69与底物Gln的范德华相互作用和Arg75,
其他文献
简介了植物造景的3个功能(表现时序景观、形成空间变化、形成地域景观特色),指出植物造景的三大原则(统一、调和、均衡),阐述了植物造景的基本手法.
数学教学的生命在于"活动",构建活动方式体系组织数学课堂教学,是把素质教育引入数学课堂的有效途径.下面介绍我们在开展《中学数学课堂活动教学的研究》中,关于"数学课堂活
应用荧光光谱法研究了50%甲醇/水体系中柚皮素、柚皮苷与溶菌酶分子间的结合反应.以Lineweaver-Burk双倒数方程和能量传递原理分别计算了两者与溶菌酶反应的结合常数(K)和结
采用特殊的化学镀方法对已制备的空心微米镍球进行表面组装,成功地在该镍球表面包覆了一层蜂窝状包覆钴层.通过FESEM,TEM,XRD衍射表征了该包覆镍球,观察到均匀包覆钴层的网眼构造
用^125I示踪法测定了不同形式的镓转铁蛋白(GaC—Tf,Ga2-Tf,GaC—Tf-FeN)与HL60细胞的结合作用.结果表明0℃、pH=7.4时Gac—Tf,Ga2-Tf和GaC-Tf-FeN均与细胞膜结合,表观结合常数分