某小学一起诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情的病原学分析

来源 :中国卫生检验杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hlexcuner
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目的确定某小学一起急性胃肠炎暴发疫情的病因。方法采集病例粪便标本和环境涂抹标本,采用实时荧光定量PCR方法检测病毒核酸。阳性标本采用一步法RT-PCR扩增诺如病毒衣壳蛋白区部分基因,将PCR产物直接测序。采用MEGA 5.0软件进行序列比对和进化分析。结果 12份粪便标本中9份呈诺如病毒阳性,检出率为75.0%,7份环境涂抹标本呈诺如病毒阴性。6份粪便标本诺如病毒衣壳蛋白区RT-PCR扩增呈阳性,其基因序列同源性为100%,均为GⅠ.6型。进化分析显示GⅠ.6型诺如病毒有2个分支,本研究命名为GⅠ.6A和GⅠ.6B。本研究所得毒株位于GⅠ.6B,与日本2012年(Gen Bank登录号AB901031)、2013年(Gen Bank登录号AB779748)报告的毒株相比同源性最高。结论该起暴发疫情由GⅠ.6型诺如病毒引起,其与日本近年同型流行株亲缘关系较近。
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