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本文选取教育部直属高校作为高校绩效评价对象，并行使用主成分分析、超效率DEA分析和Malmquist指数模型等方法，对72所直属高校进行绩效评价。其结果显示，直属高校的绩效状况基本相当，将近三分之二高校“绩效偏高”或“绩效相当”。受纯技术效率和规模效率的影响，近十年间大理类和综合类直属高校的资源配置平均效率呈现稳中有降的态势，不过规模要素对高校绩效的作用已逐渐达到临界状态；但大文类高校则表现相对稳定。此外，专任教师数量以及经费投入结构对高校绩效有显著影响。