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近年来，吴江区注重优化畜牧业结构、提高畜牧业科技创新能力、加大畜牧业养殖污染防治、完善病死畜禽无害化处理体系、推进畜禽生态健康养殖示范创建，使畜牧业由传统生产方式向生态、高效、优质、安全的现代生产方式转变，为保障畜产品市场供应和促进农业增效、农民增收发挥了积极作用。但吴江区畜牧业依然存在着养殖从业人员水平低，养殖业规模化、标准化生产程度不高，环境污染较重、群众反映强烈，养殖效益普遍不高、受行情影响大等问题，尤其是养殖业污染问题对当前建设生态健康城市提出了巨大挑战。