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根据已报道的软骨鱼、硬骨鱼、两栖类、鸟类、哺乳类和人的Sonichedgehog（Shh）基因序列，在Shh基因保守区设计一对简并性引物。利用PCR技术从多鳍鱼cDNA中扩增Shh基因。结果显示，多鳍鱼Shh基因全长1263bp。编码421个氨基酸。通过同源性比较发现。多鳍鱼与肺鱼的同源性最高，为82。5％，二级结构分析表明，Shh蛋白含有30．71％的α螺旋，21．67％的扩展线条和47.62％的无规卷曲。不含β片层；并以蛋白质结构数据库（PDB）中已解析的Shh蛋白的三维结晶结构（3D）为模板，利用h