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带叶兜兰（Paphiopedilum hirsutissimum（Lindl. ex Hook. f.）Stein）具有较高的观赏价值，是中国珍稀濒危保护植物。为了研究中国西南地区野生带叶兜兰资源的遗传特性，促进野生带叶兜兰资源的保护和利用，本研究利用SSR分子标记技术对中国西南地区广西、云南、贵州3省收集的6个居群190份带叶兜兰资源进行遗传多样性和群体遗传结构分析。结果表明，从115对引物中共筛选出10对扩增效果好的引物，10对SSR引物在190份带叶兜兰中共检测到50个等位基因，平均每个位点等位基因（Na）为5个，平均有效等位基因数（Ne）为2.4835个；平均Shannon信息指数（I）为0.8592，平均观测杂合度（Ho）为0.4518；平均期望杂合度（He）为0.4387，平均Nei’s基因多样性指数（h）为0.4370，平均多态信息含量（PIC）为0.3996。6个野生带叶兜兰居群的等位基因数（Na）为2.8000～4.3000，有效等位基因数（Ne）为1.9655～2.4060，观测杂合度（Ho）为0.3891～0.4839，期望杂合度（He）为0.3795～0.4683，Shannon信息指数（I）为0.6584～0.8369，Nei’s基因多样性指数（h）为0.3648～0.4382。广西雅长（GYC）和贵州万峰湖（QWF）居群具有较高的遗传多样性（h=0.4382，h=0.4276），广西木论（GML）居群具有最低的遗传多样性（h=0.3648）。分子方差分析（AMOVA）结果表明，遗传变异主要发生在居群内个体间（94%），而居群内遗传分化很小（6%）。基于遗传距离构建的UPGMA聚类分析结果显示，6个居群遗传距离较小，居群间遗传距离和地理位置不完全相关。Structure和主坐标分析结果表明，居群间存在均质化现象，无明显类群划分。综上，带叶兜兰资源遗传多样性较为丰富，可为中国西南地区野生带叶兜兰资源的保护和利用提供理论依据。