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自2006年转型为学术性期刊以来，在主编、编委、外审专家、作者、读者及编辑部的共同努力下，《微生物与感染》杂志已成为中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊），复旦大学学位与研究生教育国内期刊指导目录的A类（权威）期刊，被《中国期刊全文数据库》（CJFD ）知网、维普资讯-中文科技期刊数据库、万方数据资源系统数据库等收录。