PM2.5暴露对慢性鼻窦炎患者鼻黏膜上皮细胞影响的转录组学分析

来源 :中国耳鼻咽喉头颈外科 | 被引量 : 0次 | 上传用户:asdfasdf32111
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目的 研究PM2.5暴露对慢性鼻窦炎患者鼻黏膜上皮细胞(human nasal epithelial cells,HNECs)基因表达的影响,并探讨可能作用的机制。方法 6例慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的HNECs气液交界培养后分为对照组(PBS处理)和PM2.5组(100 μg/ml PM2.5处理),干预24h后提取各组细胞RNA进行转录组学测序(RNA sequencing,RNA-seq),筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并进行基因本体论(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,采用实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,RT-PCR)检测关键基因(CYP1A1、CYP1B1)的表达。结果 RNA-seq表明PM2.5组与对照组相比DEGs共279个,其中上调表达76个,下调表达203个,CYP1A1和CYP1B1是排名前两位的上调DEGs,而下调DEGs主要与DNA复制和蛋白质合成相关。通过GO和KEGG富集分析发现DEGs主要参与应激反应、氧结合、脂类物质代谢等,其中细胞色素P450(cytochrome P450,CYP450)酶起重要作用。RT-PCR结果显示,PM2.5组CYP1A1、CYP1B1表达量显著上调(P<0.05),这与RNA-seq测序结果一致。结论 PM2.5可能通过调控CYP450酶中相关基因的表达,影响脂类物质代谢诱导HNECs氧化应激和促炎反应。
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