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目的
了解耶氏肺孢子菌的药物靶位基因多态性和耐药相关基因突变的情况。
方法从148例艾滋病合并肺炎患者的呼吸道标本中扩增出51个线粒体大亚基rRNA(mtLSUrRNA )基因片段,对51例阳性样本继续进行PCR扩增,以耶氏肺孢子菌药物靶位基因二氢蝶酸合成酶(DHPS)、二氢叶酸还原酶(DHFR) 、细胞色素B(CYB)为研究靶标,对扩增产物进行测序和序列分析,与GenBank中的参考序列进行比对,分析基因多态性。
结果51例样本全部扩增出DHPS基因、DHFR基因和CYB基因,序列分析显示DHPS基因中3株(5.9%)为耐药相关突变株,48株(94.1%)为野生株;DHFR基因中1株在188碱基位点有非同义突变,21株在312位点有同义突变,30株为野生株,未发现与药物耐药相关的突变株;CYB基因在5个位点有基因多态性,其中4个为同义突变,1个为非同义突变,未发现与药物耐药相关的突变。根据这5个位点的基因多态性分型可以分为6个基因型,其中2个基因型为首次检测到,51株样本中CYB1型25株、CYB2型13株、CYB5型2株、CYB8型4株,新检测到的CYB10型4株,CYB11型3株。
结论广东地区耶氏肺孢子菌药物靶位基因出现与耐药相关的基因突变较少见,CYB基因的基因多态性明显,可作为多位点序列分型研究的靶位基因。