【摘 要】
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为了解山东省猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行情况,本研究采用RT-PCR的方法对2012年1月～2016年12月山东省13个地市采集的258份疑似PEDV感染样品进行检测,并设计引物扩增PEDV ORF3
【机 构】
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山东省动物疫病预防与控制中心,山东济南,250022
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为了解山东省猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行情况,本研究采用RT-PCR的方法对2012年1月～2016年12月山东省13个地市采集的258份疑似PEDV感染样品进行检测,并设计引物扩增PEDV ORF3基因片段,通过生物信息学软件对26个具有代表性的完整的PEDV ORF3基因序列进行遗传进化分析.结果显示PEDV平均每年检出率达72.1％,表明PEDV是当前山东地区仔猪腹泻的主要致病病原.遗传进化分析显示,26株PEDV ORF3基因序列属于G2基因型,与其它参考PEDV病毒株同源性较高(93.8％～100％),相对保守.其中3株PEDV流行株位于2a亚型中,这在华北地区属首次报道.PEDV 2a亚型基因序列具有特异位点突变,可作为鉴别2a亚型与其它亚型的分子标记.本研究揭示了山东省PEDV流行株ORF3基因的主要基因型,为该省PEDV的防控提供依据.
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