一株红霉素耐药百日咳鲍特菌的完整基因组分析

来源 :分子诊断与治疗杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：sjtulzhff

【摘要】

：

目的明确国内一株红霉素耐药百日咳鲍特菌P2013109的全基因组序列,了解其基因特征。方法对一株抗原基因型为ptxA1/ptxC1/ptxP1/prn1/fim2⁃1/fim3⁃1/tcfA2的临床分离红霉素

【作者】

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于丹栗东芳袁林冯欣史伟姚开虎

【机构】

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国家儿童医学中心/首都医科大学附属北京儿童医院/北京市儿科研究所微生物研究室/儿科学国家重点学科/教育部儿科重大疾病研究重点实验室,深圳市微健康基因研究院微生物研究部

【出处】

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分子诊断与治疗杂志

【发表日期】

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2020年2期

【关键词】

：

百日咳鲍特菌基因组序列分析系统发育树分析 Bordetella pertussis Genome sequence analysis Phylogeneti

【基金项目】

：

国家科学自然基金(81973100)

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目的明确国内一株红霉素耐药百日咳鲍特菌P2013109的全基因组序列,了解其基因特征。方法对一株抗原基因型为ptxA1/ptxC1/ptxP1/prn1/fim2⁃1/fim3⁃1/tcfA2的临床分离红霉素耐药百日咳鲍特菌P2013109采用了二代和三代高通量测序技术进行了全基因组测序,对基因组进行组装、基因预测和功能注释,并与包含我国疫苗株CS、国外疫苗株Tohama I,以及国外发表临床分离的共15株菌的完整基因组序列进行全基因组比较分析。结果P2013109的完整基因组序列总长度4126010 b

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