【摘 要】
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重复序列是基因组的重要组成部分,对生物的进化、遗传和基因的表达调控有重要作用.本研究利用生物信息学方法,在异常汉逊酵母菌株792全基因组de novo测序的基础上,对基因组重
【机 构】
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陕西科技大学食品与生物工程学院,新疆大学离子束生物技术中心,西安工业大学离子束生物工程与生物多样性研究中心,宁波市疾病预防控制中心
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(11575149,31760016);西安市未央区科技计划项目(201707);宁波市自然科学基金项目(2017A610268);陕西科技大学博士科研启动基金项目(2017BJ-48)
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重复序列是基因组的重要组成部分,对生物的进化、遗传和基因的表达调控有重要作用.本研究利用生物信息学方法,在异常汉逊酵母菌株792全基因组de novo测序的基础上,对基因组重复序列的分布特征进行了研究.结果表明,其全基因组中重复序列总长346 417bp,其中,串联重复序列238 164bp,散在重复序列108 253bp,占基因组长度的2.52%,平均每4.05Kb就有一个重复序列.微卫星DNA序列中重复单元拷贝数大多低于15次,其优势碱基类型为三核苷酸重复,重复单元基序为AAC的微卫星序列数目最多;小
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