T细胞表位（epitope）生物学上又被称为T细胞抗原决定簇，在免疫应答过程中能够被特异性分子和T细胞识别，在免疫应答有着举足轻重的作用。按照来源不同可以把T细胞表位分为内源性和外源性两种抗原，外源性抗原的产生途径：外来的抗原和溶酶体结合成内体-溶酶体，然后被来自溶酶体的组织蛋白酶和过氧化氢酶等分解成片段，和主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex, MHC)结合而成MHC-Ⅱ类复合物然后被传递到抗原提呈细胞(antigen presenting cells, APC)表层，接下来会被抗原受体(T cell receptor, TCR)辨识，从而激活辅助性T细胞最后实现免疫应答。内源性抗原的产生途径：产生于细胞内部的抗原会被蛋白酶（proteosome）体分解成很多小的多肽片段，这些小的片段会和MHC-I一起化合成为MHC-I类分子复合体并且传递在抗原提呈细胞（ABC）上，然后通过抗原受体（TCR）的识别从而激活具有毒性的T细胞实现免疫应答。通过以上的描述可知T细胞表位的产生很大程度上取决于抗原是如何被加工和提呈的，而MHC分子与抗原肽结合是抗原加工提呈过程的关键。因此，深入研究一种MHC分子能与哪些特定的抗原肽结合，探知MHC分子和抗原肽之间的结合能力，对我们更好的理解免疫的免疫的过程，疫苗的开发具有实质上的帮助。在这篇文章中我们的研究对象是MHC-Ⅱ类分子，分析方法是差分进化算法（Differential Evolution, DE）与位置特异性得分矩阵（position-specific scoring matrix, PSSM）的组合。通过对17种MHC-Ⅱ的配体建立模型，进行数据训练和分析并且和其他预测模型的结果进行对比，本文描述的模型性能更佳。