我国医院信息化建设和应用经历了20多年的发展历程，已经成为医疗服务和医院管理必不可少的技术支撑和应用工具。随着《中共中央国务院关于深化医药卫生体制改革的意见》的出台，各地围绕医院信息化建设加大了投资力度，大型信息化项目纷纷规划和实施，但与此同时如何对这些项目的应用情况进行客观评价已经成为当前面临的重大课题。本研究通过对上海市三级医院信息化现况调查,分析当前在医院信息化建设及信息化评价中存在的主要问题，并提出加强信息化评价工作的相关建议。在理论研究过程中分别运用信息悖论及需求层次理论分析了医院信息化建设投入未达预期的原因以及不同阶段医院信息化的需求特点，同时基于多元评价理论提出应该根据不同发展阶段、不同应用范围、不同评价主体建立多元化信息化评价体系，及时发现和化解影响信息化进程的阻碍因素。通过对2012年医院信息化现状调查的分析，发现上海市三级医院信息化建设在规章制度、基础设施、系统应用、信息安全等方面有了长足的进步，并达到国内领先水平，但与此同时仍然存在一些共性的问题，部分信息化应用没有达到预期效果，且普遍未开展信息化应用效果评价；而在目前国内已经开展的医院信息化评价实践中普遍存在评价工作缺乏制度保障、指标体系设计不合理、评价对象定位模糊。评价工作不够规范等主要问题。针对上述情况，本研究提出了加强上海市三级医院信息化应用评价的对策建议：①由申康中心牵头建立医院信息化评价制度，定期组织开展医院信息化评价工作，并将评价结果纳入院长绩效考核指标；②从运营管理、临床科研、患者服务等三个维度的筛选出20个效果评价指标，采用层次分析法（AHP）确定各维度及各指标的权重，并在此基础上建立一套上海市三级医院信息化应用评价指标体系；③在实践总结基础上，开展信息化评价理论研究，逐步建立和完善多元化的评价体系。