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目的通过对不同生长年限远志内生真菌研究，了解远志内生真菌群落结构与生长年限、定殖部位的关系，丰富远志内生真菌资源，对远志种植业(如开发生物农药和菌肥)中土壤改良具有指导意义。同时对其根际土壤中微生物群落结构研究，探讨不同生长年限远志根际土壤中微生物群落结构，为进一步深入研究远志栽培土壤健康提供理论依据。
方法以陕西省合阳县不同生长年限远志及其根际土为研究材料，分离远志根、茎、叶中内生真菌，提取远志内生真菌基因序列，结合培养形态对内生真菌鉴定，并对不同生长年限、不同定殖部位内生真菌进行多样性分析。利用IlluminaMiseq高通量测序法研究不同生长年限远志根际土壤中真菌、细菌、古菌群落多样性。
结果从远志中共分离得到远志内生真菌19属36种，其中镰刀属(Fusarium)和链格孢属(Alternari)为远志优势属。所占比例分别为25.00%、11.11%。一年生远志分离得到内生真菌12属19种，二年生12属21种，三年生19属34种，四年生16属27种，野生15属24种，三年生远志内生真菌丰富度、均匀度、优势度最高。随着生长年限的增加镰刀属占内生真菌总数逐渐升高。
远志根中分离得到内生真菌18属31种，茎18属32种，叶10属15种，远志茎内生真菌丰富度、均匀度、优势度最高，远志根中镰刀属所占比例最高。
野生远志根际土壤中真菌群落丰富度、多样性最高。从空白、一年生、两年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中检测出真菌12门、13门、13门、13门、12门、13门。空白、一年生、两年生、三年生、四年生土壤中占主要地位的优势菌群均为子囊菌门、待定真菌门-1、待定真菌门-2、担子菌门、球囊菌门。野生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群为子囊菌门、待定真菌门-1、待定真菌门-2、担子菌门、被孢霉门、球囊菌门。不同生长年限远志根际土壤中相同真菌群为子囊菌门、待定真菌门-1、待定真菌门-2、担子菌门、球囊菌门，这些优势菌群在空白、一年生、二年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中分别占真菌总数的97.3%、96.23%、98.9%、98.39%、99.36%、93.05%。
未栽培远志土壤中细菌群落丰富度、多样性最高。从空白、一年生、两年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中检测出细菌28门、26门、24门、25门、25门、22门。空白土壤中占主要地位的优势菌群为变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、待定细菌门、浮霉状菌门、芽单胞菌门、厚壁菌门、疣微菌门、绿屈挠菌门、CandidatusSaccharibacteria、Parcubacteria。一年生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群为变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、待定细菌门、浮霉状菌门、芽单胞菌门、厚壁菌门、疣微菌门、绿屈挠菌门。二年生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群为变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、待定细菌门、浮霉状菌门、芽单胞菌门、厚壁菌门、疣微菌门、绿屈挠菌门、CandidatusSaccharibacteria。三年生、四年生、野生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群均为变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、待定细菌门、浮霉状菌门、芽单胞菌门、厚壁菌门、疣微菌门、绿屈挠菌门。不同生长年限远志根际土壤中相同优势细菌群为变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、待定细菌门、浮霉状菌门、芽单胞菌门、疣微菌门、厚壁菌门、绿屈挠菌门，这些优势菌群在空白、一年生、二年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中分别占细菌总数的52.78%、72.97%、65.13%、75.79%、83.19%、74.68%。
两年生远志根际土壤中古菌群落丰富度、多样性最高。从空白、一年生、两年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中检测出古菌5门、5门、5门、6门、6门、5门。空白土壤中占主要地位的优势菌群为奇古菌门、广古菌门、乌斯古菌门、佩斯古菌门。一年生、两年生、三年生、四年生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群均为奇古菌门、广古菌门、乌斯古菌门。野生年生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群为奇古菌门、广古菌门。不同生长年限远志根际土壤中相同优势古菌群为奇古菌门、广古菌门，两菌在空白、一年生、二年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中分别占古菌总数的79.84%、92.58%、89.88%、94.77%、86.18%、99.32%。
结论从远志中共分离得到远志内生真菌19属36种，其中镰刀属和链格孢属为远志优势属，不同生长年限、不同定殖部位内生真菌种群数量、丰富度、均匀度、优势度存在差异。不同生长年限远志根际土壤中真菌、细菌、古菌群落分布丰度和群落多样性表现出一定的差异性，不同生长年限远志根际土壤中真菌、细菌、古菌各门类组成比列会发生变化，为进一步深入研究远志土壤改良提供理论依据。
方法以陕西省合阳县不同生长年限远志及其根际土为研究材料，分离远志根、茎、叶中内生真菌，提取远志内生真菌基因序列，结合培养形态对内生真菌鉴定，并对不同生长年限、不同定殖部位内生真菌进行多样性分析。利用IlluminaMiseq高通量测序法研究不同生长年限远志根际土壤中真菌、细菌、古菌群落多样性。
结果从远志中共分离得到远志内生真菌19属36种，其中镰刀属(Fusarium)和链格孢属(Alternari)为远志优势属。所占比例分别为25.00%、11.11%。一年生远志分离得到内生真菌12属19种，二年生12属21种，三年生19属34种，四年生16属27种，野生15属24种，三年生远志内生真菌丰富度、均匀度、优势度最高。随着生长年限的增加镰刀属占内生真菌总数逐渐升高。
远志根中分离得到内生真菌18属31种，茎18属32种，叶10属15种，远志茎内生真菌丰富度、均匀度、优势度最高，远志根中镰刀属所占比例最高。
野生远志根际土壤中真菌群落丰富度、多样性最高。从空白、一年生、两年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中检测出真菌12门、13门、13门、13门、12门、13门。空白、一年生、两年生、三年生、四年生土壤中占主要地位的优势菌群均为子囊菌门、待定真菌门-1、待定真菌门-2、担子菌门、球囊菌门。野生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群为子囊菌门、待定真菌门-1、待定真菌门-2、担子菌门、被孢霉门、球囊菌门。不同生长年限远志根际土壤中相同真菌群为子囊菌门、待定真菌门-1、待定真菌门-2、担子菌门、球囊菌门，这些优势菌群在空白、一年生、二年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中分别占真菌总数的97.3%、96.23%、98.9%、98.39%、99.36%、93.05%。
未栽培远志土壤中细菌群落丰富度、多样性最高。从空白、一年生、两年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中检测出细菌28门、26门、24门、25门、25门、22门。空白土壤中占主要地位的优势菌群为变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、待定细菌门、浮霉状菌门、芽单胞菌门、厚壁菌门、疣微菌门、绿屈挠菌门、CandidatusSaccharibacteria、Parcubacteria。一年生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群为变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、待定细菌门、浮霉状菌门、芽单胞菌门、厚壁菌门、疣微菌门、绿屈挠菌门。二年生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群为变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、待定细菌门、浮霉状菌门、芽单胞菌门、厚壁菌门、疣微菌门、绿屈挠菌门、CandidatusSaccharibacteria。三年生、四年生、野生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群均为变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、待定细菌门、浮霉状菌门、芽单胞菌门、厚壁菌门、疣微菌门、绿屈挠菌门。不同生长年限远志根际土壤中相同优势细菌群为变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、待定细菌门、浮霉状菌门、芽单胞菌门、疣微菌门、厚壁菌门、绿屈挠菌门，这些优势菌群在空白、一年生、二年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中分别占细菌总数的52.78%、72.97%、65.13%、75.79%、83.19%、74.68%。
两年生远志根际土壤中古菌群落丰富度、多样性最高。从空白、一年生、两年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中检测出古菌5门、5门、5门、6门、6门、5门。空白土壤中占主要地位的优势菌群为奇古菌门、广古菌门、乌斯古菌门、佩斯古菌门。一年生、两年生、三年生、四年生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群均为奇古菌门、广古菌门、乌斯古菌门。野生年生远志根际土壤中占主要地位的优势菌群为奇古菌门、广古菌门。不同生长年限远志根际土壤中相同优势古菌群为奇古菌门、广古菌门，两菌在空白、一年生、二年生、三年生、四年生、野生远志根际土壤中分别占古菌总数的79.84%、92.58%、89.88%、94.77%、86.18%、99.32%。
结论从远志中共分离得到远志内生真菌19属36种，其中镰刀属和链格孢属为远志优势属，不同生长年限、不同定殖部位内生真菌种群数量、丰富度、均匀度、优势度存在差异。不同生长年限远志根际土壤中真菌、细菌、古菌群落分布丰度和群落多样性表现出一定的差异性，不同生长年限远志根际土壤中真菌、细菌、古菌各门类组成比列会发生变化，为进一步深入研究远志土壤改良提供理论依据。