非居民企业间接转让股权是当今国际税收领域的一个热点问题，且饱受各方争议。近年来，由于非居民企业的跨国投资活动越来越普遍，其股权转让增值收入则成为境外投资者越来越重要的投资回报。在复杂的国际投资事物中，投资者往往出于考虑国与国之间的税收问题，因此间接转让股权模式被越来越多的非居民企业采用。目前，我国已经出台关于非居民企业间接转让股权方面的法规文件，并规定对非居民企业的股权转让所得实施源泉扣缴，以确保非居民企业所得税款能够顺利完整入库。然而，针对非居民企业通过境外中间控股公司间接转让股权的现象，我国税务机关通常判定其滥用组织形式，缺乏合理商业目的说明，即按照“经济重于形式”原则重新认定该所得为来源于我国的收入，对该股权转让所得征收企业所得税。通过对我国征管现状的分析，发现我国侧重对经济实质原则的介绍，并直接运用于税务实践当中，而缺乏从实际案例中来把握实质课税原则的运用；在判定非居民企业是否具有合理商业目的方面，我国欠缺可实际操作的税收法规，通过对我国企业所得税法、一般反避税条款及相关法规文件的研究，我国均未明确规定合理商业目的的判定标准及原则；正由于上述问题，关于非居民企业间接转让股权征税权存有诸多争议，主要表现在法理基础脆弱和合理商业目的认定两方面；因此，我们更应该从法理角度重新审核中间控股公司的法律形式和合理商业目的，结合具体案例具体分析的原则，从个案的异同中提炼出普遍的适用法则，公平公正地实现我国的税收管辖权。本文通过对国内经典间接转让股权的案例比较评析，借鉴国际立法与实践经验，从而得出一些针对我国非居民企业间接转让股权有意义的启示，以期对未来我国非居民企业间接股权转让的反避税工作有所帮助。