新疆土壤盐渍化越来越严重,导致耕地逐渐退化、土地大面积的荒漠化,给生态环境与农业生产造成了严重的不良影响。系统化地评价棉花品种的耐盐性能、选育抗逆品种并对其耐盐机制展开解析,能够对大面积的盐碱地进行有效、充分的利用,从而将可利用的土地资源进行不断拓展,让土地的利用率得到进一步提高。为研究陆地棉耐盐性和遗传分析,对耐盐碱性棉花品种的选育进行强化,促进盐碱地棉花产业的发展,本研究在大田盐胁迫条件下,从形态、生理、分子三个层次调查分析陆地棉花铃期和吐絮期的农艺性状、筛选耐盐鉴定指标,分析319份陆地棉种质资源的耐盐性。使用关联分析,挑选得到5个与耐盐有关的分子标记,从而为改进陆地棉耐盐种质资源及新品种选育提供参考。结果表明:1.田间调查319份陆地棉材料的13个性状,并且计算其遗传多样性指数平均值为2.04,进而证明陆地棉在遗传多样性较为丰富。农艺性状与产量性状表现为正相关性的居多;5个主成分累积贡献率为87.60%;聚类分析将材料划分成七类,其中的第V类材料被选作为耐盐性资源材料,用来筛选与挖掘耐盐性基因。2.对319份陆地棉花铃期叶片理化指标进行测定,并进行相关性分析和聚类分析。盐胁迫下可溶性糖含量的均值于对照条件下减小32.50%,POD（过氧化物酶）活性较对照条件下减小9.70%,而其他指标较对照条件下差异并不大。从相关性得出超氧化物歧化酶活性与可溶性蛋白含量呈显著负相关,与可溶性糖含量呈极显著正相关。当欧几里德距离为5时,聚类分析结果分为5类,其中的第Ⅲ类共3份,此类材料可以挑选出来作为理化指标上高耐盐的材料。3.采用隶属函数值法,主成分分析法和聚类分析法确定了 28种陆地棉种质花铃期的耐盐性。用隶属函数法和主成分分析可以将光合及生理生化的12个指标综合成5个累积贡献率为82.71%的成分,并且得到D值（综合耐盐得分）,接着用聚类分析将28份材料分为四类,这为棉花的快速筛选和鉴定提供参考。4.对棉花3个产量构成因素（单铃重、衣分和铃数）进行统计分析得到:在高盐浓度下棉花衣分不变,表明衣分受盐浓度影响小。铃数受盐浓度影响最大,随着盐浓度降低而铃数显著上升。结合SNP位点对3个产量性状（在4个盐梯度下）进行关联分析,得到5个高频QTNs,分别为TM69725（8,SBW）、TM11620（7,LP）、TM57073（7,SBW）、TM69745（7,LP）、TM55934（6,LP）。