【摘 要】
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本研究采用高通量测序、基因筛选、荧光定量PCR等技术分别对羽化后2天、3天、5天、7天的异色瓢虫卵巢进行分析,并对得到的基因进行了进一步的功能预测和注释。本文的主要结论
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本研究采用高通量测序、基因筛选、荧光定量PCR等技术分别对羽化后2天、3天、5天、7天的异色瓢虫卵巢进行分析,并对得到的基因进行了进一步的功能预测和注释。本文的主要结论是:1、研究得到21.5Gb的RNA数据。每个时期的的表达分别为羽化后1天22364281,3 天 18460991,4 天 20636344,7 天 24531820。得到 12985 个 GO注释的基因片段,8144个KEGG注释基因片段,KOG注释,Pfam注释,Swiss-Prot注释和nr注释的片段数量分别为17235,16822,16863和28186,总共得到了28558个可注释基因片段。2、通过比较发现,S1时期和S2时期之间有134个基因上调表达基因和828个下调基因。S1时期和S3时期之间有524个基因上调表达基因和810个下调基因。S1时期和S4时期之间有4994个基因上调表达基因和4646个下调基因。3、筛选出26个与卵巢发育高度相关的基因,其中参与极粒形成的基因数量为1个,属于信号转导机制的22个,与卵黄蛋白形成相关的基因有3个。4、为了验证测序的结果,随机选择20个差异表达基因进行荧光定量试验,结果表明,测序结果与荧光定量的结果是一致的。5、从26个卵巢发育基因中,选择较为重要的卵黄蛋白基因进行结构分析,并与其他昆虫进行比较分析该基因在生物进化中的地位。
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