S公司是当前上海自贸区洋山区域的主体开发企业,具体负责开发洋山保税港区内的6平方公里区域。S公司作为新成立的国有开发企业,目前工程管理岗位专业工程师配备数量不足,而开发体量却相对较大,这和短期内大规模、高标准、多样化的物业需求形成了供需矛盾。在此情况下,S公司必须重点做好工程项目建设管理工作。本论文选取S公司新建保税仓库项目管理作为研究对象,以帮助S公司优化工程项目管理、降低建设成本、加速工程进度、提升项目质量,形成良好的综合竞争力,并最终实现对区域发展的拉动作用。最近几年,有多位国内外学者基于不同角度,应用相关管理学科理论和工具,针对国内外工程项目的管理开展了研究探索。本论文在总结归纳国内外各专业学者的理论以及应用实践的基础之上,从建设工程项目质量管理、工程项目进度管理以及工程项目投资造价管理等基础理论出发,将上海自贸试验区X保税仓库工程项目作为具体研究案例,分析了项目建设过程当中的一系列实际问题,并分别基于安全、进度、质量以及投资造价等角度做出探讨,同时提出具体有效的解决对策,最终形成一整套具备现实操作意义的“多方综合控制”工程项目管理体系,以期能够为上海自贸试验区内后续新建工程项目管理提供参考与借鉴。