论文部分内容阅读
目的：神经管缺陷(NTDs)是常见的出生缺陷之一，为出生一年内婴儿死亡的首要病因，世界各地均有发生，平均发病率为1‰。目前认为NTDs的发生是环境因素与遗传因素综合作用的结果，但其具体病因以及所涉及的相关基因尚未阐明。由于cDNA微阵列能够同时鉴别出同一时间基因表达差异，本研究利用基因芯片技术从基因水平探索与NTDs相关的基因，探索其与NTDs的关联性。
方法：样本为孕43周男性无脑儿，经阴道助产分娩。提取该婴儿病变骨组织总RNA，以正常骨组织作对照。用紫外分光光度计和变性胶电泳分别检测RNA的质量和完整性后，利用U133Plus2.0型基因芯片检测样本中基因的表达。比较其基因表达差异，筛选差异表达的基因，结合生物信息学分析。
结果：病变骨组织和正常骨组织所获的总RNA OD260/OD280分别为1.9和2.0，终浓度分别为0.5968 ng/μl和0.6051ng/μl，变性胶电泳图谱显示质量良好，达到cDNA微阵列的检测标准。芯片杂交出65530个基因。其中两倍以上上调基因2362个，下调基因1219个。16倍以上上调基因48个，6倍以上下调基因24个。16倍以上上调基因中与细胞分化相关的基因有7个，分别为NHLH2、OTX2、NEUROD1、EN2、OLIG1、INSM1和PAX6；6倍以上下调基因中与细胞分化相关的基因只有CSRP3。
结论：利用cDNA微阵列技术筛选到了一批NTDs病变骨组织和正常骨组织差异表达的基因，了解这些基因可以帮助我们揭示NTDS发展过程的潜在分子机制，这为进一步研究奠定了坚实的基础。