番茄由于其产量高,营养丰富,食用性好,适应性强,成为世界上最主要的蔬菜作物之一。随着番茄保护地栽培面积的扩大以及保护地的特殊环境使得番茄病害日益严重,枯萎病是生产中最严重的病害之一。选育抗枯萎病的番茄品种是防治枯萎病最经济最有效的方法。本实验根据I-2基因序列设计PCR引物,利用直接测序方法检测番茄抗感品种I-2基因的DNA序列,发现SNPs。以其为3’端设计等位基因特异引物及其互补引物,研究了特异引物3’端碱基错配类型和位置对等位基因特异PCR的影响,并对50份种质资源进行了SNP分型。实验主要结果如下：1针对番茄抗枯萎病I-2基因设计三对嵌套引物,将从抗感番茄材料中获得的I-2基因测序并与Genbank上I-2基因序列比对,筛选抗番茄枯萎病的SNP标记2个：1793位C/T及1963位G/A。2研究了引物3’端不同位置碱基错配及不同碱基错配类型对PCR结果的影响。研究表明引物3’端第1,2位碱基错配对抑制等位基因特异引物与模板的结合起重要作用；C/T错配强于C/A错配；设计引物引入强错配并置于3’端第二位与SNP相隔一个碱基,获得了特异性条带也可以有效地阻止非特异性的扩增。3优化PCR反应体系：退火温度58℃, Mg2+2.5mM, dNTP250μmol·L-1提高了反应的准确性。4应用筛选特异引物,对50份番茄种植资源进行鉴定,筛选出抗枯萎病材料39份,与人工接种调查结果基本一致。