RNA能够形成复杂的二级和三级结构。RNA三螺旋是一种重要的三级结构基序,存在于许多假结和其他结构的RNA中。早在60多年前,Gary Felsenfeld等人首次在体外观察到了RNA三螺旋,但三螺旋结构的生物学活性才刚刚开始得到重视。目前已有大量的证据表明,它们可能参与各种生物过程,包括转录调节、转录后的RNA加工、染色质修饰和DNA修复。一般而言,RNA三螺旋的稳定性是影响它们在生理条件下应用的关键因素。然而,由于Hoogsteen碱基配对,三螺旋的稳定性比相应的母本双螺旋低,这限制了它们的实际应用。因此,如何去提高三螺旋RNA的稳定性是急需解决的问题。在这方面,能够识别、结合和稳定三螺旋特定序列的小分子有很大需求。考虑到钌配合物在靶向DNA研究领域所表现出来的突出优势,我们课题组在近十年的时间里致力于设计高度模块化的钌（II）配合物并研究它们靶向三螺旋RNA时所具有的结合行为。因此,本文系统性的设计并用多种生物物理技术研究了一些模块化钌配合物与三螺旋RNA的结合行为。本文首先重点综述了三螺旋核酸的相关基本知识,包括三螺旋核酸的定义、结构、形成模式、分类系统、生物学意义以及常见的结合剂。之前Barton、Nordén和我国的计亮年院士等人的研究表明,手性钌（II）配合物在靶向DNA时具有明显的对映选择性。基于此,本文首先合成了主配体上取代基电子性能不同的两对手性钌（II）配合物,分别研究了它们与三螺旋RNA的相互作用。结果表明,相比于Λ-对映体,Δ-对映体与三螺旋RNA的结合亲和力更强,对三螺旋RNA具有更强的稳定效应。接着,本文研究了dppz基上取代基电子效应和辅助配体效应的差异在钌（II）配合物靶向三螺旋RNA中所扮演的重要角色。研究表明,具有强吸电子性和更大疏水性的配合物是优良的稳定剂。其次,研究表明并不只有插入剂能够作为三螺旋RNA的稳定剂。例如,我们最近报道的几个富含赖氨酸、甘氨酸和精氨酸的高电荷阳离子钌（II）多吡啶金属肽配合物以氢键、静电相互作用和疏水相互作用为驱动力与三螺旋结合,显著提高了三螺旋RNA的稳定性。此外,考虑到含有大环多胺单元的新型高水溶性钌（II）配合物[Ru（phen）2L’]2+在光激活时能有效地裂解DNA质粒。因此研究了基于联吡啶单元的大环多胺配体及其配合物对三螺旋RNA的稳定效应。结果表明,母本配合物上引入大环配体能显著改善其对三螺旋的稳定性。最后,研究了主配体上-CN取代基位置的差异对三螺旋RNA稳定性的影响。研究表明,具有邻位氰基的配合物对三螺旋RNA的稳定性更为显著。