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菌根对于兰科植物的正常生长是必不可少的，菌根真菌可促进兰科植物种子萌发，提高组培苗出瓶成活率，促进幼苗生长等。同时兰科植物根系中也经常分离出大量的子囊菌内生真菌，它们对兰科植物的生长发育的作用往往被低估。国内外学者常着眼于一些常规技术难于萌发的珍稀濒危兰科植物与共生真菌之间的相互作用关系，从而达到大规模繁殖的目的，解决市场对珍稀濒危兰科植物野生资源的大量需求问题。因此全面的收集兰科共生真菌资源，加强珍稀濒危野生兰科植物共生真菌的研究工作对保护兰科植物独特的野生资源，保存其物种和遗传多样性，具有非常重要的意义。
独花兰(Changnienia amoena)属兰科(Orchidaceae)独花兰属(Changnienia)，是我国特有的单种属植物，是优良的野生花卉与珍贵的药用植物。为了对不同生境下独花兰根系共生真菌种群结构与多样性进行系统性的研究，本文从浙江天目山大镜坞、浙江天目山开山老殿、湖北神农架和安徽天堂寨四个生境下的野生独花兰根系中分离共生真菌，结果如下：
1.共分离到67个菌株，通过形态学观察和ITS rDNA分子生物学手段的方法，进行了菌株的分类鉴定，绝大多数为子囊菌(Ascomycetes)，其余为担子菌(Basidiomycetes)和接合菌(Zygomycetes)。从浙江天目山大境坞分离得到27株真菌，包括柄孢壳菌属(Podospora)19株，正青霉属(Eupenicillium)6株，炭角菌(Xylaria)1株，毛壳菌(Chaetomium)1株。从浙江天目山开山老殿分离到6株真菌，包括胶膜菌属(Tulasnella)2株，炭角菌2株，柔膜目菌(Helotiales)2株。从安徽天堂寨分离到22株真菌，毡状金孢属(Geomyces)7株，柔膜目3株，炭角菌6株，瓶霉(Phialophora hyalina)1株，被孢霉属(Mortierella)1株，烧瓶状霉(Lecythophora)1株，粪盘菌属(Ascobolus)3株。从湖北神农架分离到12株真菌，毛壳菌4株，从赤壳属(Neonectria)1株，生赤壳属(Bionectria)6株，粪盘菌属1株。
2.四个生境下共生真菌种群组成有很大差别，优势种群显著不同，物种多样性较丰富且多样性指数相差较大。Shannon-Weiner指数H安徽天堂寨最高，其次是湖北神农架，天目山开山老殿和天目山大境坞。Simpson多样性指数D安徽天堂寨最高，湖北神农架与天目山开山老殿次之，最低是天目山大境坞。综合2个多样性指数表明安徽天堂寨的多样性最高，其次是湖北神农架，天目山开山老殿，天目山大境坞。
3.分离得到的柔膜目真菌和炭角菌属内生真菌呈现较丰富的多样性，9株炭角菌菌株可归属于三个分支群，5株柔膜目菌株隶属于二个分支。