死亡受体6相互作用蛋白质的筛选与鉴定

来源 :第二军医大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:yummyumi
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
肿瘤坏死因子超家族(TNFSF)及其相应的受体超家族(TNFRSF)在细胞功能调控方面具有重要地位,其调控作用涉及细胞的多种行为,与机体的生理和病理过程密切相关。截止目前,至少对19种配体和29种受体进行了深入地研究。死亡受体6(DR6),即TNFRSF21,是新近发现的TNFRSF成员,但其相应的配体至今没有报道。本研究首先采用细菌双杂交系统在人肝细胞cDNA文库中筛选得到了可能与DR6相互作用的分子,对其中的hepsin与maspin进行了重组表达,在胺化磁珠上证实了重组蛋白与DR6的结合。本研究还编写了基于蛋白质密码理论的多肽筛选软件,应用该软件从hepsin与maspin分子中筛选到了可能与DR6相互作用的多肽序列,选择合成了其中部分多肽,在细胞模型上观察到了这些多肽诱导细胞凋亡的作用。这些结果表明:hepsin与maspin可能为DR6的配体或相互作用蛋白。 一、细菌双杂交系统在细胞外蛋白质相互作用研究中的应用 利用已知的TNF相关凋亡诱导配体(TRAIL)与其3个受体(DR4、DR5、OCIF/OPG)相互作用的关系,分析细菌双杂交系统研究细胞外蛋白相互作用的可行性。以带四环素(T)抗性的pTRG构建编码TRAIL细胞外可溶性区域表达质粒;以带氯霉素(C)抗性的pBT构建编码DR4,DR5,OCIF/OPG的细胞外区域序列质粒。所构建的质粒分别相应共转化带卡那霉素(K)抗性的报告菌株XL1-Blue MRF,铺于含250~500μg/ml羧苄青霉素(C),15μg/ml四环素(T),34μg/ml氯霉素(C),50μg/ml卡那霉素(K)的15 cm的LB平皿(LB-CTCK),即报告基因产物以抗羧苄青霉素作为转录激活的指标,然后再以β-半乳糖苷酶活性进行验证。所构建的pTRG-TRAIL与pBT-DR4,pTRG-TRAIL与pBT-DR5及对照组分别共转化后,在500μg/ml羧苄青霉素的LB-CTCK筛选下宿主菌呈转录激活状态,pTRG-TRAIL与pBT-OPG组共转化后在250μg/ml羧苄青霉素筛选下宿主菌呈转录激活状态。阳性克隆皆可在X-Gal-PETG-TCK平皿可以进一步验证。对照组pTRG-TRAIL与pBT-LGF2,pBT-DR4与pTRG-Gal11,pBT-DR5与pTRG-Gal11或pBT-OPG与pTRG-Gal11四组共转化后呈阴性。 由于所用的双杂交序列皆为编码TRAIL受体的细胞外区域,而这些蛋白质之间 王粤华博士学位论灰死亡受体6相王作用蛋白质的饰迄与鉴定的相互作用已有验证,由此证实了细菌双杂交可以用于细胞外蛋白质相互作用的研究。同时证实了OCIF/OPG与TRAIL能直接结合,但亲和力较TRAIL与DR4、TRAIL与DRS要低。二、细菌双杂交系统筛选与DR6相互作用的分子 以pBT构建编码DR6细胞外区域(43一234aa)与Fc片段融合表达的质粒,与Stratagene公司购买的细菌双杂交用人肝细胞cDNA文库(以pTRG构建)共转化xLI一Blue MRF,铺于250协g/m1梭节青霉素的LB一cTCK平皿。24h后长出大量菌落 (>300个/平皿),随机挑选10个克隆进行测序,结果显示筛选到的主要是与Fc片段结合的蛋白编码序列。提高梭节青霉素浓度至500卜g/ml阳性克隆略有减少(约100个/平皿)。 将DR6细胞外区域编码序列直接插入pBT,按上述方法在500林g/ml羚节青霉素的LB一CTCK平皿上筛选了8轮次,共计360余块15 cm平皿,每次的转化效率在2x107一6xlo7间。结果共得到1200余个阳性克隆,用x一Gal一PETG平皿进一步验证,得到了约300个阳性克隆,全部进行了插入片段的序列分析。剔除已知只存在于细胞内(如核内、胞浆、线粒体等)的蛋白编码序列,共12次得到抗胰蛋白酶(alphal一antitryPsin),4次hePsin,2次未知的同一新基因,2次白蛋白,2次补体IY亚单位,2次转铁蛋白(ferritin)及maspin、克隆刺激因子1受体、A一n脂蛋白、c脂蛋白、C反应蛋白、视黄酸受体a、血清类粘蛋白1、血清素等编码序列各1次。调研文献分析所报道这些蛋白的功能和研究现状,选择了H型跨膜蛋白丝氨酸蛋白酶家族分子hePsin与丝氨酸蛋白酶抑制剂家族分子maspin进行进一步研究。三、重组表达hcPsin与masPin,胺化磁珠法分析与DR6的结合 设计相应的引物,以肝细胞cDNA文库为模板,PCR扩增了其中的 hePsin细胞外区域和maspin成熟肤的编码序列,插入pMALTM Protein Fusion and PurifieationSystem(New England Biolabs公司)中的pMAL一eZ载体,进行与麦芽糖结合蛋白 (MBP)融合的原核重组表达。表达产物用试剂盒所带的直链淀粉亲和层析柱初步纯化,达到电泳纯。DR6细胞外区域同样表达并纯化。 将hepsin、maspin及MBP蛋白分别共价结合于旺源胺化(NHZ一terminated)磁珠 (云南旺源生物科技有限公司,WB 130)上,再用过量的人血白蛋白饱和磁珠。各组各分成2管,1管加入适量纯化的重组表达的DR6,另l管以MBP为对照,4℃轻摇王架毕博士檬位论失死亡受体6相王作用番白质的拜透与鉴定lh。分别分析DR6、MBP加入前、后蛋白浓度的变化。结果DR6浓度在hepsin与ma印in实验组显著降低,而MBp浓度基本无变化,说明DR6与hepsin或maspin能相互结合。四、基于蛋白质密码理论编写分析软件,以验证masPin和hcPsin中与DR6的结合区域 蛋白质密码理论认为,蛋白质分子相互识别的信息储存于它们的编码DNA序列中,编码受体/抗原基因的反义核营酸序列中的
其他文献
选取凤凰山滑雪场C7419、C7421、C7422、C7423、C7424共5个站点2018年11月15日—2019年3月31日的气温、风速资料变化特征进行统计并与国家基本气象站(50526)数据进行对比。分
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
目的:“安全剂量”的有机磷农药对人体真无害吗?这是涉及疾病控制和公共卫生的一个重要的问题。本研究探讨大鼠新生期暴露亚中毒阈剂量(“安全剂量”)有机磷农药毒死蜱(Chlorp
<正>当我们要想了解某种艺术的发展史,就有必要先了解这门艺术的流派。流派与历史有着莫大的关系,它们与历史一起而孕育、成长和沦亡的。所谓"流派",应是有着某种相同的美学
<正>国际银团贷款市场发展趋势银团贷款(syndicated loan)普遍存在于国际主要金融市场中,通常指两家或两家以上的银行,依据同样的贷款条件,并使用共同的贷款协议,向借款人发
文章针对应县木塔及杭州六和塔进行了对比研究,探讨了地域性的文化历史背景对古建筑的影响。其中,当地地理气候决定了建造材料和结构体系,建筑担当的社会角色和功能决定了其
人类疱疹病毒6型(Human Herpesvirus,HHV-6)属于疱疹病毒β亚科,分为HHV-6A和6B两个亚型。HHV-6是引起婴幼儿急疹(exanthem subitum,ES)的病原,其感染具有广泛的亲组织和细胞嗜性
非裔美籍作家爱丽丝·沃克在《紫色》中有意让茜莉采用黑人英语来叙述,而让娜蒂在信中几乎全用标准英语,甚至让非洲的土著居民也用标准英语;同时她在用黑人英语与标准英语之