本研究面向创新型国家建设、和谐社会构建以及社会主义新农村建设的战略目标，开展后发地区科技创新体系研究，为促进后发地区发展提供理论基础和实践参考。后发地区的发展，关键在于生产力又快又好发展，核心在于科技创新能力不断增强，基础在于区域科技创新体系发展完善。本文以协同学为理论基础，深入研究后发地区科技创新体系的建设和完善等关键问题，取得了以下成果： (1) 提出了区域科技创新体系的概念，论述了该系统的内涵。区域科技创新体系是国家(大区域)科技创新体系的一个重要组成部分，由特定区域内的企业、大学、科研机构、政府组织和科技中介服务机构等创新主体构成的开放式有机网络体系，其目的是促进区域内科学技术的创新，并加速创新成果转化成现实的生产力，从而推动区域社会经济的发展，其本质上是关于科学技术促进经济社会发展的一种制度安排。因此，它所包括的企业、大学、科研机构、政府组织和科研中介组织五大创新要素，构成了一个完整的自组织系统。 (2) 结合研究对象的特性和协同学理论的特点，将协同理论用于对后发地区科技创新体系的研究，分析后发地区科技创新体系中主体运作的协同机制，探索促进后发地区科技创新体系(即系统)优化的途径。 (3) 经过理论研究和案例分析，明确了后发地区科技创新体系主体协同运作的模式。即政府是服务性质的主体，起宏观调控的作用；大学主要是培养创新人才和承担部分的基础研究和应用研究工作；科研机构主要进行基础研究和部分应用研究；科技中介组织将以上各个主体有机的联系起来，起到桥梁和纽带的作用。各个创新主体既要充分发挥各自的功能和作用，同时更要加强与其他主体的协作，共同促进区域科技创新体系的完善和后发地区的发展。 基于上述理论研究和实证分析，文章还提出了促进后发地区科技创新体系建设和完善的意见和建议。