肝癌患者与健康志愿者唾液N-糖蛋白质组的比较研究

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糖基化是一种常见的翻译后修饰,它在蛋白折叠、转运、定位及维持蛋白稳定等许多细胞过程发挥重要作用。而细胞生长、分化、细胞间信号传递、免疫反应、微生物致病及其他生物过程也受糖基化的影响。更重要的是,在许多疾病的发生过程中发现了蛋白糖基化的改变,目前美国FDA已批准的疾病生物标志物中大多数都是糖蛋白。因此,糖蛋白质组学研究受到了越来越多的关注,研究者期待随着糖蛋白质组学的逐步发展,挖掘出更多新型特异且可靠的疾病生物标志物。生物体液如血浆/血清、唾液、尿液都可作为生物标志物起始研究的样本。人类唾液作为一种潜在的诊断体液近年来获得了越来越多的关注:它采集简单,易于存储,并且已有研究表明唾液蛋白质组与血浆蛋白质组存在很大重合,这些特点都使得唾液成为一种潜在的理想诊断体液。本实验采用亲水亲和与酰肼化学相结合的方法并联用LC-MS/MS分别分离纯化和鉴定了肝癌患者和健康志愿者的唾液N-糖蛋白,绘制唾液N.糖蛋白质组图谱,并结合生物信息学分析对肝癌患者和健康志愿者唾液N-糖蛋白质组进行了比较研究。本实验在肝癌患者唾液中共鉴定263条非冗余N-糖肽,117个N-糖蛋白;在健康志愿者唾液中共鉴定125条非冗余N-糖肽,75个N.糖蛋白。其中,肝癌患者和健康志愿者共有N-糖蛋白50个,肝癌患者特有唾液N.糖蛋白67个,健康志愿者特有唾液N-糖蛋白25个;两组共有N.糖肽77条,肝癌患者特有186条,健康志愿者特有50条。肝癌患者特有唾液糖蛋白和糖肽数量均高于健康志愿者。对所鉴定的肝癌患者和健康志愿者唾液N.糖蛋白的物理性质分析表明唾液N-糖蛋白主要是中低分子量的酸性糖蛋白质且健康志愿者唾液N.糖蛋白酸性强于肝癌患者唾液N-糖蛋白。GO分析表明所鉴定到的肝癌唾液N-糖蛋白主要是胞外域蛋白、细胞蛋白和一些细胞器蛋白;主要参与细胞过程、生物调节,代谢过程,应激反应,免疫过程,定位以及信号转导等生物学过程:在生物结合、生物催化和抗氧化等方面发挥重要作用。将鉴定到的肝癌唾液N-糖蛋白与KEGG数据库中的人类代谢及疾病通路进行匹配,共发现19种唾液N-糖蛋白可匹配于9条KEGG通路,其中有8种N-糖蛋白可匹配于补体和共凝集级联反应通路。此外,本实验结果表明酰肼化学和亲水亲和方法在N-糖蛋白/糖肽的提取中各有其特异鉴定的N-糖蛋白/糖肽,有较显著的互补性。综上所述,本实验首次以唾液为研究对象,对肝癌患者和健康志愿者唾液N-糖蛋白组进行了比较研究,为肝癌的唾液糖蛋白质组学研究提供了重要科学数据,同时也为肝癌的唾液诊断研究奠定基础。
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