【摘 要】
:
具有基因开关的合成基因网络是从自然基因网络中提取出来的一种典型基因网络模块,能够减少自然基因网络研究的复杂性,便于简单有效地进行理论分析和实验研究。并对于解决一些实际问题有着重要的意义,如:信息存储与编码、生物技术等。此外基于生物波动框架,其外部环境中存在着大量非高斯的Lévy随机扰动。因此,本文对外部Lévy随机扰动对一类具有基因开关的合成基因网络的影响及其引起的随机共振问题进行了研究。主要创新
【基金项目】
:
国家自然科学基金委(项目:11602003);
论文部分内容阅读
具有基因开关的合成基因网络是从自然基因网络中提取出来的一种典型基因网络模块,能够减少自然基因网络研究的复杂性,便于简单有效地进行理论分析和实验研究。并对于解决一些实际问题有着重要的意义,如:信息存储与编码、生物技术等。此外基于生物波动框架,其外部环境中存在着大量非高斯的Lévy随机扰动。因此,本文对外部Lévy随机扰动对一类具有基因开关的合成基因网络的影响及其引起的随机共振问题进行了研究。主要创新点为:在以往稳定性研究的基础上,研究了非高斯Lévy噪声引起的随机共振现象,如经典随机共振、相干共振、逻辑随机共振及逻辑门切换等。并建立了该系统相干共振和逻辑随机共振的信息论度量方法。具体研究内容如下:(1)研究了Lévy噪声下具有基因开关的合成基因网络的稳定状态分布。通过相关的生化反应关系,分析并建立了具有基因开关的合成基因网络模型以及分析了稳定状态的分布情况。且分析了外部Lévy飞行超扩散环境引起的Lévy噪声对稳定状态分布的影响。讨论了Lévy噪声的稳定性指标、偏斜度参数和噪声强度对具有基因开关的合成基因网络中蛋白质浓度状态切换的稳态概率密度函数的影响。研究发现Lévy噪声稳定性指标的降低、偏斜度参数的增加和噪声强度的增加能够促进蛋白质浓度在高低稳定状态间的切换。(2)研究了Lévy噪声及谐和激励下具有基因开关的合成基因网络的经典随机共振。通过对信噪比的分析,发现Lévy噪声引起了信噪比的非线性最优变化趋势,即产生了经典随机共振。当Lévy噪声及谐和激励在高或低浓度的蛋白质上时,Lévy噪声强度的增加能够促进蛋白质浓度在高低稳定状态间的切换,并且Lévy噪声稳定性指标、偏斜度参数和谐和激励振幅的增加能够抑制或促进经典随机共振的最优协作。(3)研究了Lévy噪声下具有基因开关的合成基因网络的相干共振。提出了运用信息论方法度量具有基因开关的合成基因网络的相干共振。分析了不同Lévy噪声参数下蛋白质浓度状态在切换过程中的切换比率、噪声熵及信道容量随噪声强度呈现的非线性最优变化趋势。也就是Lévy噪声作用下产生了相干共振现象。且Lévy噪声的稳定性指标和偏斜度参数的增大能够提高蛋白质浓度状态在切换过程中的切换比率及信道容量,并且降低其中的噪声熵。(4)研究了Lévy噪声和方波信号下具有基因开关的合成基因网络的逻辑随机共振。提出运用信息论方法度量具有基因开关的合成基因网络的逻辑随机共振。分析了不同Lévy噪声参数下逻辑信息传输过程中的误码率、噪声熵及互信息以及互信息的同步程度。研究发现具有基因开关的合成基因网络在一定参数下实现了NOR/OR逻辑门。且逻辑信息传输的误码率、噪声熵和互信息随着噪声强度的变化呈现非线性最优变化趋势。说明Lévy噪声引起具有基因开关的合成基因网络在实现的逻辑门下产生了逻辑随机共振现象。同时Lévy噪声稳定性指标的逐渐增加,降低了逻辑信息传输的误码率和噪声熵,提高了逻辑信息传输的互信息,且稳定性指标的逐渐降低加快了互信息的同步变化。(5)研究了Lévy噪声和方波信号下具有基因开关的合成基因网络的逻辑门切换和逻辑随机共振。分析了三组系统参数和Lévy噪声参数下的逻辑信息传输,并发现在适当参数调节下具有基因开关的合成基因网络可以实现NOR/OR、NAND/AND和NSGN/SGN逻辑门之间的切换。并利用二维驱动成功率,分析了所实现的三类逻辑门在不同Lévy噪声稳定性指标、偏斜度参数和噪声强度的两两参数下的可靠性。研究发现随着噪声强度的变化,驱动成功率呈现出非线性最优变化趋势,即在实现的三类逻辑门下Lévy噪声引起具有基因开关的合成基因网络发生了逻辑随机共振现象。
其他文献
外物理场控制下的二元相分离是科学实验和工业生产中调控分离相形态的一种重要物理过程和普遍方法,其外场控制的主要手段包括温度场控制、剪切场控制、声场控制和电磁场控制等。相分离也是一种分离相变,其演化过程往往对外部控制环境的微小变化,表现出复杂、敏感、瞬时和多尺度演化的响应特征,例如气液临界相变对温度和压强变化的大尺度敏感响应就是一种典型的二级相变过程。而这种分离相变的多尺度变化特征往往导致其非平衡演化
经济周期波动以及经济增长问题一直是宏观经济研究中的重要课题和研究热点,对其进行理论和应用研究对于宏观经济政策的制定具有极其重要的指导意义。考虑到经济周期波动中经济变量的记忆性质,本文引入了分数阶导数来刻画这一性质。同时,引入了时滞参数来刻画实际经济系统中不可避免的时间滞后现象。随后,构建了具有生态环境破坏的经济增长模型,分析了不同生态环境治理措施下的效率和作用以及随机扰动对经济系统的影响。论文的主
冷原子干涉实验中涉及复杂的激光调制技术,为调制器提供合适的射频驱动信号至关重要,驱动信号的相噪直接影响了冷原子干涉仪的灵敏度。设计了一种能够产生6.834GHz信号的低相噪信号源,该信号源采用二级锁相环频率合成技术,将恒温晶振输出的10MHz信号倍频到100 MHz,再将100 MHz信号倍频到7 GHz,最后与外部DDS芯片产生的166 MHz信号混频实现6.834 GHz微波信号源。经过测试,
因为分数阶模型相对于整数阶模型能更准确的描述系统特性,所以最近几十年来分数阶微积分的研究得到了众多学者的关注。本论文针对典型分数阶随机系统提出了不同的近似解析方法,并使用数值方法验证了提出方法的有效性。本论文的结构和内容如下:第一章,简单介绍了分数阶微积分的历史,并回顾了目前随机分数阶系统、随机碰撞系统和随机能量采集系统的研究现状。第二章,研究了高斯白噪声激励下含有两类分数阶导数项的Van der
退化椭圆障碍问题起源于机械工程,金融数学,图像重建等各种应用学科,是偏微分方程及其应用领域中研究的重要课题.本文主要研究由非交换向量场构成的退化椭圆障碍问题弱解的正则性,推广并改进了欧氏空间中的相关结果.主要工作如下:1.考虑Carnot群上具有VMO系数的p-Laplace型拟线性退化椭圆障碍问题弱解的CX1,α“正则性.首先基于齐次群上一致亚椭圆算子的Lp估计及Calderon-Zygmund
混合流体力学是一门研究两种或者多种流体运动规律和应用的学科.从理论角度,混合流体力学利用质量守恒和动量守恒等规律,通过精确的数学模型来描述流体的运动,这个模型就是通常所说的混合流体动力学方程.本文主要研究的混合流体模型包括气体-液体两相流模型、流体-质子交互作用模型以及热力学框架下推导的混合流体模型.主要的结果如下:·研究三维粘性气体-液体两相流模型的爆破准则.我们在Dirichlet边界条件和N
流体力学方程组不仅具有重要的物理背景和应用前途,而且也是非线性偏微分方程理论中最重要的研究方向之一.这类方程的研究,不管是理论上的,或是用数值计算方法,都能帮助我们认识流体粒子的运动规律.而Navier-Stokes方程组是流体力学中最重要的方程组之一.本文主要研究可压Navier-Stokes方程弱解存在性及真空状态的动力学行为和简化两层半模型弱解存在性.主要结果如下:·研究三维球对称等熵可压N
如今非线性现象越来越多的出现在自然科学与社会科学中,用来描述该现象的微分方程受到相关数学家和物理学家的关注.本文主要研究了几个偏微分方程的非局部对称和守恒律以及精确解.包括两分量μ-Camassa-Holm方程,带有色散项γux的μ-Camassa-Holm方程,Foursov方程,复Camassa-Holm方程.本文还考虑浅水波方程3×3的谱问题,构造了Degasperis-Procesi方程和
EQ-代数是高阶模糊逻辑对应的真值代数结构,BCI-代数是组合逻辑中BCI-系统的代数表述,伪BCI-代数是BCI-代数的非可换推广.本文分别以模糊集对应的随机集的落影和广义的概率测度-态为主要研究内容,分别建立了EQ-代数上的落影模糊理论和伪BCI-代数上的态理论.主要内容包括:1.将模糊集和概率理论相结合,建立了EQ-代数上的落影模糊理论.首先,引入了EQ-代数的落影模糊前滤子,讨论模糊前滤子
为了满足空间高精度测量系统应用需求,本文在超稳晶振小型化原理样机研制基础上,完成了对主振电路低噪声改善及高精度控温电路的设计优化,实现了星载超稳晶振(USO)工程样机。USO产品本体尺寸为99mm×88mm×53mm,经测试产品中短期频率稳定度为1.35E-13/1s、2.04E-13/10s、5.47E-13/100s、6.70E-13/1000s(Allan方差)、相位噪声优于-125dBc/