饰纹姬蛙（Microhyla fissipes）隶属于两栖纲(Amphibia)无尾目(Anura)姬蛙科(Microhylidae)，广泛分布于东亚且支系内遗传分化明显(Matsui et al.，2005;Yuan et al.2016)。饰纹姬蛙分布于秦岭以南的广大地区，西至红河，东达台湾岛，南达海南岛、西沙部分岛屿。　　本研究采集饰纹姬蛙58个种群892号标本，检测其遗传多样性，重建该类群的系统发育关系，进而探讨其分化的式样与机制;深入解析四川盆地饰纹姬蛙的遗传多样性格局。获得的主要结果如下:　　1.微卫星位点筛选:　　成功筛选饰纹姬蛙四碱基重复微卫星位点15个，检测5个种群105号标本的平均等位基因数(N)为8.5(4～13)，平均观测杂合度(Ho)为0.71(0.26～0.90)，平均期望杂合度(He)为0.74(0.63～0.90)。表明这些微卫星位点可以用于种群遗传多样性分析。　　2.饰纹姬蛙的遗传多样性与谱系分化:　　(1)基于微卫星位点多样性的遗传多样性与谱系分析　　检测了24种群391号标本，显示平均等位基因数7.0(3.9～9.4)，平均观测杂合度0.70(0.49～0.80)，平均期望杂合度0.76(0.62～0.86)，平均多态信息含量0.70(0.56～0.81)。种群间遗传分化系数(Fst)平均为0.21(0.02～0.38)，其中2.54％的为Fst＜0.05，20.65％的为0.05＜Fst＜0.15，48.91％的为0.15＜Fst＜0.25，27.89％的为Fst＞0.25，表明饰纹姬蛙种群间呈高度分化状态。　　基于24种群391号标本的10个微卫星位点，Structure的分析结果表明饰纹姬蛙可分为2大组，四川盆地及盆周山地的种群聚为第一组，其余种群构成第二组，第二组可分为3小组（小组1:云贵高原东部和华中地区西南部，包括贵州独山、湖北麻阳、湖南桑植、湖北武汉;小组2:华南地区，包括广东、广西;小组3:华东华北地区，包括东部沿海各地区以及陕西洋县）。表明四川盆地及盆周山地种群构成了一个独立的单元。　　分析2大组的基因流发现，基因流大致从四川盆地，经由云贵高原，向华南地区扩散，同时华东华北地区也向华南地区扩散。　　遗传分化和地理因素相关性分析得出，饰纹姬蛙的种群遗传分化在受到地理距离的影响较弱，只有华南地区（包括广东、广西）的种群遗传分化与地理距离的相关性是显著的。　　(2)基于线粒体基因片段序列的遗传多样性与谱系分析　　测定了54种群291号标本的线粒体Cytb基因片段序列和55种群597号标本的COI基因序列。整合有关已发表序列（183条）比对后的Cytb序列片段长588bp，变异位点53个，有26种单倍型;COI序列片段长618bp，变异位点77个，有47种单倍型。海南种群和大陆的种群没有共享单倍型。　　基于线粒体两种基因片段所建的系统发育树拓扑结构一致，显示饰纹姬蛙的分布大概为2个支系3个大的类群，其一是以四川盆地为主的四川盆地地块，包括部分云贵高原及华中过渡地区;第二大类群是华东沿海地区;第三大类群是华南地区，包括广西南部地区以及海南岛。这也印证了由核基因分子标记分析所得出的结果。部分节点支持率不够高，说明支系间的关系不明确。　　历史种群动态分析显示饰纹姬蛙可能经历了近期扩张的过程，且存在亚分化。　　3.四川盆地饰纹姬蛙种群遗传多样性与格局:　　(1)遗传多样性结构分析　　检测了29种群567号标本的10个微卫星位点的多态性，平均有效等位基因数7.5(5.4～8.8)，平均观测杂合度0.74(0.64～0.82)，平均期望杂合度0.74(0.64～0.77)，平均多态信息含量0.68(0.59～0.72)。平均Fst为0.06(0.01～0.17)，其中35.47％的为Fst＜0.05，63.55％的为0.05＜Fst＜0.15，0.99％的为0.15＜Fst＜0.25。此结果表明饰纹姬蛙在四川盆地及其周边范围内呈中低度分化状态。　　Structure的分析结果表明四川盆地饰纹姬蛙可分为两组，一组由盆中丘陵区、成都平原南部及盆周南部山地种群组成;一组由盆周北部及东南部山地种群组成。　　分析29种群间的基因流发现，四川盆地内部各种群间基因交流频繁;长江在三峡地区显示出了明显的隔离效应，阻碍了种群间的基因流动。　　四川盆地29种群的线粒体Cytb单倍型4种、COI单倍型17种，拼接后的序列单倍型11种，且单倍型网络图均呈星状分布。　　历史种群动态分析表明四川盆地饰纹姬蛙近期可能经历了种群扩张。　　(2)遗传距离与地理距离的关系　　四川盆地内遗传分化和地理因素相关性分析得出，盆地内种群的遗传分化受到的地理距离影响较弱，且海拔等对其影响效果也不明显。　　(3)适宜生态位的模拟分析　　生态位模型分析显示，目前该物种在整个盆地分布广泛;且四川盆地的饰纹姬蛙，从末次冰期至今，适宜分布区范围扩大。　　结合单倍型网络图、历史种群动态分析、生态位模拟结果，发现四川盆地饰纹姬蛙近期发生了种群扩张，可能自西向东的长江水系成为了促进饰纹姬蛙种群扩散的动力。　　该项工作成果有利于澄清饰纹姬蛙的系统学问题，对制定物种保护策略具有重要指导意义，为深入阐明该地区物种多样性格局形成的动力、机制、过程等问题提供支撑。