本研究对60个草菇菌株进行出菇品比试验,根据农艺性状筛选出16个在生产和育种上种性相对优良的核心菌株,又利用分子标记技术对遗传距离进行了测定,并根据不同的育种目标,组配出4对杂交组合,建立了一套草菇种质资源评价和杂交育种亲本选配体系。通过研究孢子保存与草菇担孢子萌发的关系,我们得到了单孢分离最佳的孢子保存温度和时间,即孢子在20℃下保存1天。单孢分离最佳的孢子萌发条件,即35℃培养箱中培养24小时。由于草菇属于初级同宗结合食用菌,其单孢具有可孕性,为解决草菇生产中存在的问题,更好的改良草菇品种,对草菇单孢菌株进行了一系列研究。包括单孢菌株的形态特征与分类、菌丝生长速度的测定还有单孢菌株出菇能力的比较。我们发现单孢菌株的菌落形态各异,具有多样性,按菌落主要特征可分为气生菌丝发达浓密型和无气生菌丝、匍匐贴于培养基生长型两类。经出菇试验发现,凡是能够出菇的单孢菌株,其气生菌丝浓密发达,生长速度快且会形成大量厚垣孢子。利用筛选出来的单孢菌株两两配对杂交,对其菌落交界处的菌丝进行尖端分离和菌落特征观察,发现无法利用菌落形态特征来准确鉴定杂交子,必须利用分子标记手段来进行辅助育种。本研究采用SCAR分子标记进行杂合子的鉴定,证明SCAR标记较其他分子标记更加可靠和稳定。本研究通过种质资源研究、杂交亲本选配、单孢分离、配对杂交和杂交子鉴定成功获得一个杂交种,虽然农艺学性状达不到优良新品种的要求,但建立了草菇这一初级同宗结合菌类杂交育种的研究体系,相信只要获得更多的单孢菌株和杂交子就一定能够育出性状优良的新品种。