基于16S rRNA测序的银屑病患者肠道菌群结构的研究

来源 :河北医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yeshenshi1
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目的:应用16S rRNA测序的方法,对银屑病患者和健康志愿者进行肠道菌群结构的分析与比较,初步探讨银屑病患者肠道菌群结构的特征,为银屑病的治疗提供新的方向。方法:选取12名符合纳入标准的银屑病患者(P组)及12名健康志愿者(C组),收集受试者的粪便样本,进行DNA提取、目的片段PCR扩增、构建文库、上机测序等步骤,测序后进行OTU聚类、α-多样性分析、β-多样性分析等生物学信息分析。结果:1.两组在性别、年龄及BMI指数无统计学差异(P>0.05);2.经OTU聚类共获得5430个OTU,两组相同的OTU共有2667个,P组特有1596个,C组特有1167个;3.α-多样性分析显示,银屑病组和健康对照组的肠道菌群丰度及多样性无明显差异(P>0.05);4.β-多样性分析显示,两组间菌群结构有统计学差异(P<0.05);5.组间差异物种分析发现,10余个物种丰度较高且在组间具有显著性差异,其中P组中显著增加的有梭菌纲(Clostridia)、丹毒丝菌科(Erysipelotrichaceae)、消化链球菌科(Peptostreptococcaceae)、布劳特氏菌(Blautia)等;显著减少的有Negativicutes、韦荣球菌科(Veillonellaceae)、小杆菌属(Dialister)、巨单胞菌属(Megamonas)、瘤胃球菌(Ruminococcaceae_UCG-002)等。结论:1.与对照组相比,银屑病患者肠道菌群的丰度及多样性在统计学上无显著差异。2.与对照组相比,银屑病患者肠道菌群结构发生了显著变化。3.银屑病患者肠道菌群结构具有特征性。4.肠道菌群结构变化可能与银屑病发病相关。
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