新型农民专业合作社是我国在农业现代化进程中重要的新型农村经营主体。这一主体的成长与发育动力来自不同性质的要素所有者——普通农户、大户、公司、供销合作社、农村服务部门以及基层政府等——在合作中“有限理性”地进行策略选择,实践自己“利润最大化”的动机。因此,研究合作社中各参与主体行为与组织制度的关系,及其对组织绩效的影响,探索如何提高合作社的组织绩效是一个值得关注的现实问题。本文采用理论分析与实证研究相结合的方法,以规模经济理论、俱乐部理论、行为经济学理论、产业组织理论以及新制度经济学的相关理论为研究基础,以湖南省的农民专业合作社为研究对象,通过理论分析,问卷调查和计量分析等方法,对合作社参与主体行为与组织制度的关系及其对绩效的影响进行了研究,结果表明：(1)考虑到我国农村经济和农户的现实状况,参与主体多元化是我国在当前经济背景下,大力发展农民专业合作社的现实选择。(2)演化博弈分析的结果说明合作社参与主体行为与组织制度存在交互作用和共同演进的关系。(3)因子分析的结果表明,湖南省新型农民专业合作社的绩效整体不强。新型农民专业合作社绩效的主要影响因素从大到小排列分别是：社会影响、组织发展、组织运营、社员收益和组织规模。(4)Logistic回归的结果表明,新型农民专业合作社中参与主体的行为和组织制度对组织绩效有影响。其中,是否配备专职会计、第一大股东持股比例、合作社发起人是否非农户、附加表决权比例和理事会投资比例等因素对农民专业合作社的组织绩效影响显著。因此,提升我国农民专业合作社的组织绩效需要做好以下四个方面的工作：(1)肯定多元发起主体在新型农民专业合作社发展中的积极作用。(2)从产权制度、内部治理结构和机制、利益联结制度及进入与退出制度等方面,不断完善合作社的内部制度。(3)根据新型农民专业合作社不同发展阶段的需要,完善相关的法律、法规及相关政策,推动合作社规范化的发展。(4)政府要转变支持的重点和方式,提高公共服务供给的数量和质量,为新型农民专业合作社的发展营造良好的外部条件。本文创新点：一是研究视角创新：首先,将新型农民专业合作社的研究放到建设新型工业化、信息化、城镇化和农业现代化的宏观背景下进行研究。然后,对不同参与主体之间的合作进行考察分析,多层次研究参与主体的行为、组织制度对组织绩效的影响。最后,选择湖南省的农民专业合作社为研究样本,是对中部合作经济欠发达地区研究的补充。二是研究的方法创新：本研究以产业组织理论、组织行为学理论、新制度经济学理论和演化博弈理论为基础,既有对合作社发展现状的描述,也有对合作社样本的统计建模和分析。将不同参与主体行为与组织制度的关系,及最终在绩效上的表现结合起来,力图立体地展现新型农民专业合作社的发展规律,以期得到新的研究成果。