公共交通枢纽是各种交通流的交汇点和乘客的换乘点，也是区域交通网络的重要节点，主要功能是实现枢纽内乘客在多种交通方式下的高效换乘。公共交通枢纽内部各类公共交通方式的智能化管理、各类运输方式之间高效协同与应急指挥的研究是各类公共交通方式高效衔接运转的关键。　　本文首先对我国公共交通枢纽协同调度系统的需求及功能进行分析，其次确定以乘客的时间费用和运营商费用为总成本的模型目标，以各方式的车辆配置及各方式间的运能匹配为约束条件建立了综合公共交通枢纽内各方式协同的调度模型，制订了公共交通枢纽站客运方式一体化时刻表，充分考虑了不同的公共交通方式之间的协同换乘。对比了运营计划协调前后公共交通网络的各部分费用变化，分析表明协调优化促进了枢纽站各客运方式的合理衔接，实现了网络总费用的优化。在制定一体化时刻表的基础上，为满足乘客实时的需求，同时进一步克服公交车辆运行随机性的影响，本文基于卡尔曼滤波方法对公交行程时间进行了预测和公交线路实时OD矩阵预测，建立了动态协同调度模型。公共交通枢纽经过运营调度的协调有效降低了乘客换乘费用，优化了系统成本，提高了公共交通服务质量。　　运用案例推理的方法建立了公共交通枢纽站应急预案决策模型，根据公共交通枢纽站紧急事件原因的复杂特点，研究探讨了应急指挥管理模型的建立和决策模型的设计过程.　　本论文重点研究在公共交通枢纽中的公共交通协同管理与应急指挥系统的相关研究与应用，通过对信息流的整合与应用，优化运营管理流程，提高枢纽的运行效率、管理水平和服务水平为实现多种运输方式间的协调联动、调度指挥提供支持。提高应急快速响应能力，提高安全疏散的效率，通过试点工程案例的应用支撑，初步建立公共交通枢纽中公共交通协同管理与应急指挥系体系架构。从而为枢纽站信息服务设计提供了依据。