当前，随着计算机网络技术的迅速发展，计算机快速转向开放的、网络平台的、协同工作方式。基于Agent理论和技术尤其是MAS的理论和技术给我们带来了设计和实现分布与开放环境中运行的软件系统一个全新模式。 本文主要是研究多Agent分布式系统的组织结构和协同。在总结当前几种组织形式基础上提出了部分结点蜕化的混合式组织结构。本文分析了现在通常采用的Agent协同方法，提出基于生态学和经验的竞价拍卖合同网协议，采用的选择次高价竞价拍卖策略能在与简单拍卖相同的通信量上达到类似于传统竞价拍卖的效果，对传统的合同网协议进行改进，在消息传播中加入约束机制和对Agent不能完成任务时不采取转变角色重新招标而采用违约惩罚和信用机制，减少了系统的通信量和系统的复杂度，最后在此基础上实现一个基于FIPA标准的多Agent电子商务原型系统。 协同是实现多Agent系统核心和关键，采取合理的组织结构、进行有序的协同规划和应用合适的协同协议是实现协同的正确方法，本文正是在此基础上对多Agent系统的组织结构和协同做了有益的探讨。