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雀形目(Passeriformes);是现存鸟类中种类最多、适应辐射最广的类群,其系统发育关系一直存有争议。已有学者采用采用线粒体DNA等分子标记对部分雀形目鸟类的分子系统发育关系进行了一些探讨,但种类有限。本文通过PCR扩增、直接测序或克隆测序,对来自四川地区的部分雀形目鸟类的线粒体DNA细胞色素b基因全序列(1143 bp)和CoⅠ基因部分序列(1176 bp)的组成特点及其系统发育关系进行了比较分析,尤其针对分类地位上目前还存在争议的鸫亚科、画眉亚科鸟类,分别以树麻雀(Passer montanus)、荒漠伯劳(Lanius isabellinus)和灰树鹊(Dendrocitta formosae)为外群构建它们的系统发生树,深入探讨了这两个亚科鸟类的系统发育关系及其分类地位。主要结果如下：1)获得了69种雀形目鸟类的Cytb基因全序列和CoⅠ基因部分序列,联合数据集序列长度为2319 bp,共有变异位点1000个,占总位点数的43.1%；简约信息位点923个,占变异位点数的92.3%；T、C、A、G碱基的平均含量分别为24.8%、32.2%、27.6%、15.4%。2)Sibley & Ahlquist分类系统中雀小目(Corvida)的莺总科(Sylvioidea)、鹟总科(Muscicapoidea)和雀总科(Pasesoridea)三个类群,以及鸦小目(Passerida)的鸦总科(Corvoidea),在本文中得到进一步验证,但莺总科为非单系类群。山雀属(Parus)为一单独类群；长尾山雀类与莺亚科鸟类的关系远比与山雀属鸟类的关系近,不是山雀科(Paridae)的一个属。攀雀科(Remizidae)应归属于莺总科。燕雀类与鹀类的分歧达到科级水平,分别归属为燕雀科和鹀科。3)鸫亚科鸟类为非单系,被分为2个支系,一个支系包括鸫属(Turdus)和地鸫属(Zoothera)。另一个支系包括红尾鸲属(Phoeicurus)、鸲属(Tarsiger)、燕尾属(Enicurus)和啸鸫属(Myiophonus)。宝兴歌鸫(Turdus mupinensis)独立于鸫属而与虎斑地鸫(Zoothera dauma)形成单独一个分支,宝兴歌鸫的分类地位独特。4)画眉亚科鸟类被分为2大支系,非单系。传统认为属于画眉科的鵙鹛属(Pteruthius)、鳞胸鹪鹛(Pnoepyga albiventer)和褐胁雀鹛(Alcippe dubia)与画眉亚科其他物种之间亲缘关系很远,而暗绿绣眼鸟(Zosterops japonicus)置于画眉亚科中,其分类地位需要重新认识。并证实噪鹛属(Garrulax)和雀鹛属(Alcippe)为多系类群。鸦雀属(Paradoxornis)属于画眉亚科,穗鹛(Stachyris)和钩嘴鹛(Pomatorhinus)具有较近的亲缘关系,联合数据集未能较好地反映希鹛属物种在形态上的差异。5)研究表明CoⅠ基因能够为重建鸟类系统发育关系提供足够的系统发育信息。基于与联合数据集的比较分析,COⅠ基因适合用于分析科内属间系统发育关系,当然它也能作为鉴别物种的分子标记,但不够稳定、准确,因此,本文建议应联合其他分子标记组合分析。