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苹果矮化密植栽培因其产量高、果实品质好、早果早产及方便生产管理，成为现代苹果生产的发展趋势。矮化砧木的选育及利用是实现矮化密植的主要途径。但是因各地苹果矮化砧木的预选方法不一使矮化砧木的更新换代及在生产上的应用受到限制，因此，探索迅速准确的苹果矮化砧木预选方法，并将其应用于实际的选育工作中去，不仅利于苹果杂种实生苗的早期筛选，还可以降低田间管理成本、加快矮化砧木育种进程。本试验以3类矮化程度不同的苹果砧木为试材，研究不同矮化程度苹果砧木间形态指标及生理生化指标的差异，并将所得结果加以应用，以27个待选砧木为试材，确定适宜的预选矮化砧木的指标，同时筛选出矮化砧木，主要结果为：1、矮化程度不同的砧木间枝皮率差异显著。半矮化砧木的枝皮率显著高于乔化砧木，显著低于矮化砧木的枝皮率。2、不同砧木气孔密度差异较大，并且差异显著。矮化砧木的气孔密度较小，显著低于半矮化砧木与乔化砧木的气孔密度。各砧木的气孔横径并无显著差异，但矮化砧木的气孔纵径却显著高于半矮化与乔化砧木。3、不同矮化程度的砧木之间叶片内的POD、IOD酶活性差异较大，并且乔化砧木的酶活性显著低于半矮化、矮化砧木的酶活性；不同时期各砧木叶片的SOD酶活性差异较大，且各砧木间酶活性显著不同，但是SOD酶活性与砧木的矮化程度并无相关性；5月30日，半矮化砧木的CAT酶活性显著高于矮化砧木的CAT酶活性，并且显著低于乔化砧木的CAT酶活性，9月30日，不同砧木间CAT的酶活性相比于5月30日有所下降并且差异减小，乔化砧木叶片内CAT酶活性显著高于半矮化、矮化砧木的CAT酶活性，但是，半矮化砧木叶片内CAT酶活性与矮化砧木的CAT酶活性无显著性差异。4、不同砧木间叶片内源激素IAA、ABA、GA3和ZR的含量差异较大，且各单一的激素指标与砧木的矮化性无显著相关性；矮化砧木的IAA/ABA、（IAA+GA3+ZR）/ABA的比值均显著低于半矮化砧木与乔化砧木，而半矮化砧木与乔化砧木间IAA/ABA、（IAA+GA3+ZR）/ABA的比值差异并不显著；各砧木间GA3/ABA、ZR/ABA差异不显著。5、同一时期不同砧木间叶片内一氧化氮含量的差异较大，半矮化砧木叶片内一氧化氮含量显著高于矮化砧木叶片内一氧化氮含量，并且显著低于乔化砧木叶片内一氧化氮含量。6、不同时期不同砧木叶片内多胺的含量表现为：乔化砧木叶片内腐胺含量显著高于半矮化砧木与矮化砧木；半矮化砧木叶片内亚精胺、总胺含量显著低于乔化砧木叶片内亚精胺、总胺，显著高于矮化砧木叶片内亚精胺、总胺含量；9月30日，半矮化砧木叶片内精胺含量显著高于矮化砧木叶片内精胺含量，并且显著低于乔化砧木叶片内精胺含量；同一时期不同砧木叶片内腐胺/(亚精胺+精胺)、腐胺/亚精胺、腐胺/精胺与亚精胺/精胺的比值无显著差异。7、5月30日，乔化砧木叶片内钙离子含量显著低于半矮化砧木与矮化砧木叶片内钙离子的含量；9月30日，各砧木叶片内钙离子含量明显增加，且矮化砧木叶片内钙离子含量显著高于乔化砧木叶片内钙离子含量，显著低于半矮化砧木叶片内钙离子含量。8、对比分析各指标与砧木矮化程度的相关性，确定枝皮率、气孔密度、IOD酶活性、CAT酶活性、亚精胺含量、多胺总量及一氧化氮含量7个指标为矮化砧木的初选指标，并根据这些指标对待选砧木进行筛选。通过对7个指标的选中率、漏选率、错选率及准确率四个参数的对比分析，确定枝皮率、气孔密度、多胺总量及一氧化氮含量为适宜的矮化砧木预选指标。根据所选定的4个指标，从27个待选砧木中初选出7个矮化砧木，分别为ST、2号、6号、SH37、28号、111号、178号，与其实际生长势对比之后，确认初选准确率为85.71%。