小麦高密度遗传图谱构建和产量、穗部和籽粒大小性状QTL分析

被引量 : 17次 | 上传用户:coudoudou
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
泰农18是本课题组选育的矮杆、抗倒伏、高产、优质的品种。为了解析其高产的遗传基础,本研究利用泰农18和小麦品系临麦6号杂交构建RIL群体,利用DArT和SNP等高通量分子标记绘制高密度遗传图谱;多年调查产量及其构成要素、穗部性状和籽粒大小性状,并对这些性状进行QTL分析,以期获得控制这些性状的重要QTL,为进一步进行相关基因克隆和育种工作奠定基础。本研究主要结果如下:利用总数超过15.6万的SSR、DArT和SNP标记扫描RIL群体的184个株系,构建了一张包含10739个标记位点的高密度遗传图谱。该图谱覆盖小麦全部21条染色体,包括5399个独立位点,其它5340个标记表现共分离,其中包括105个SSR标记位点,1506个SNP位点和3788个DArT标记位点。该图谱包括43个连锁群,图谱总长度为3394.47cM,每条染色体平均长161.64cM,独立位点之间的平均遗传距离0.63cM。其中1B染色体标记密度最高,标记间平均距离0.27cM;3B染色体最长,为308.98cM,包括539个独立位点,标记之间的平均距离为0.57cM。该图谱标记数目多,图谱密度高,大量的多态性标记,便于对目标性状进行QTL精细定位;除了高通量的DArT和SNP标记,还有已经广泛应用于遗传图谱构建的SSR和DArT(wpt系列),便于本研究的结果与前人的研究进行比较分析。ANOVA分析结果表明,顶部不育小穗数的环境间变异不显著,小区产量(GY)的基因型间变异达到0.05的显著水平,其它性状的基因型和环境间的变异都达到极显著水平(p≤0.001);多数性状在亲本泰农18和临麦6号之间表现明显的差异,并且所有性状在RIL群体中出现超亲分离;GLW的遗传力最高,为67.79%,GY的遗传力最低,为12.95%。检测到涉及14个性状的416个QTL位点(662个单一环境QTL),位于小麦的21条染色体。单个QTL可解释表型变异的4.38%~37.70%,LOD值最大值为20.78。在检测到的所有QTL中,包括产量及其构成要素(GY、SN、GN、TGW)的103个QTL、穗部性状的102个QTL和211个籽粒大小性状(GL、GW、GH、GLW、FFD和GV)的QTL。其中产量及构成要素的单个QTL可以解释表型变异的4.76~23.05%,穗部性状的单个QTL可解释表型变异的4.63~37.70%,籽粒大小性状的单个QTL可解释表型变异的4.38~22.24%。共检测到76个高频表达QTL(RHF-QTL),包括233个单一环境QTL,占检测到QTL总数的35.2%,分布在除3A、3D、4D和5D外的17条染色体上,分别包括10、21和45个产量及其构成要素、穗部性状和籽粒大小性状的QTL。其中有18个RHF-QTL可以在所有三个环境和AV中检测到,包含5个穗部性状(QSl-5A.2、QSl-6A.3、QSl-6B.1、QTss-5A.1和QBsss-6A.2)和13籽粒大小性状(QTgw-1B.1、QTgw-1B.4、QTgw-6A.3、QGl-2D.1、 QGl-4A.1、 QGl-5B.1、 QGl-5B.3、 QGw-1B.1、 QGlw-1B.1、 QGlw-2D.4、QGlw-5B.1、QGlw-7A.3、QGlw-7B.2)的QTL。另外,分别检测到4个控制粒高(QGh-1B.1、QGh-6A.2、QGh-7B.1、QGh-7B.2)和籽粒体积(QGv-5B.1、QGv-6B.1、QGv-6D.1、QGv-7B.1)的RHF-QTL在调查的所有2个环境中都能检测到。涉及到3个或3个以上性状的QTL置信区间重叠的QTL形成了56个QTL簇(C1-C56),分布在除1A、3A、3D、4D外的17条染色体上,包括168个性状-QTL位点。根据这些QTL簇涉及的性状将其分成5种类型:类型Ⅰ:涉及产量及其构成要素、穗部性状和籽粒大小性状,25个QTL簇属于该类型,其中C1、C24、C26、C29、C30、C31、C36、C37、C38、C39、C43、C44等12个QTL簇含有RHF-QTL;类型Ⅱ:涉及产量及其构成要素和穗部性状,3个QTL簇属于该类型,其中位于2B染色体上的C15包含一个RHF-QTL(QTss-2B);类型Ⅲ:涉及产量及其构成要素和籽粒大小性状,该类型有11个QTL簇,其中C3、C20、C40、C42、C54和C56等6个QTL簇含有RHF-QTL;类型Ⅳ:涉及穗部性状和籽粒大小性状,有12个QTL簇,其中C6、C10、C16、C32和C51等5个QTL簇含有RHF-QTL;类型Ⅴ:只涉及籽粒大小性状,有5个QTL簇,其中C25、C41和C53等3个QTL簇含有RHF-QTL。从QTL簇涉及的性状之间的相关性、QTL的加性效应和条件QTL的角度分析,发现了3个重要的QTL簇。我们推测位于1B上的C1区间上产量的增加是通过千粒重的提高来实现的,而粒宽和粒高的增加又促进了千粒重的提高;位于6A染色体上QTL簇C38区间穗粒数的增加可能主要是由于基部不育小穗数的减少引起的,而穗长增加也在一定程度上增加了穗粒数,同时粒长、粒宽和粒高的增加共同促进了千粒重的提高;位于7B染色体上控制GY(QGy-7B)和籽粒大小(QTGw-7B、QGw-7B.2、QGh-7B.2、QGlw-7B.2和QGv.2)的QTL簇C54可能是由于粒宽和粒高的效应促进了千粒重的增加,进而提高了产量。对穗粒数及穗部相关性状、千粒重及籽粒大小性状进行条件QTL分析的结果表明,影响穗粒数的最主要因素是基部小穗不育,其次是可育小穗数,然后是穗长和顶部小穗不育;而在籽粒大小方面,粒宽和粒高对于千粒重提高的作用大于粒长。
其他文献
研究目的半侧颜面短小畸形(Hemifacial microsomia,HFM)的主要临床表现是单侧上下颌骨发育不良导致面部不对称。既往由于对疾病认识不足或治疗时机选择不同,儿童期未进行矫治
生活上无人照料、经济上丧失支援、精神上痛苦不堪、无人养老送终,是失独家庭所必须直面的多重困境,而我国对失独家庭的法律保护却几近为零。因无法突破理论和立法局限,现阶
随着科技发展的日新月异,自动化物流技术得到了广泛的应用,自动化立体仓库(AS/RS)更是在不同领域扮演越来越重要的角色。自动化立体仓库具有节约用地、自动化程度高、减轻劳
目的研究黄芪与抗生素联合应用对福氏痢疾杆菌感染后大鼠肠功能的影响,为治疗肠道感染后所致的肠道感觉运动功能紊乱提供指导。方法将40只雄性Wistar大鼠分为正常对照组、模
大规模开放式网络课程以其"微视频"、"随堂测试"和"在线交流"的特点,颠覆了传统的课堂教育模式。从军校教师的教学水平、课程建设改革和开放教学资源建设三个方面,分析了慕课
詹姆斯·乔伊斯被誉为20世纪最伟大、最具有深远影响的爱尔兰小说家之一。他的众多作品被公认为文学经典。其作品中独特的艺术写作手法为现代文学的发展增添了奇光异彩。本文
二分思维是一种对立性思维,它忽视或掩盖二分双方的互动和勾连,将二分的双方对立化了。在间性思维中,不再有主客的对立和隔绝,间性思维主张接纳他者、客体,把他者、客体当作
[目的]对正常兔眼给予三七总皂苷滴眼剂,设立衡量滴眼剂对眼表的刺激性指标,探讨三七总皂苷(PNS)滴眼剂对兔眼眼表的刺激性反应,证实三七总皂苷滴眼剂在兔眼眼表应用的安全性
结合多年的实际工作经验,就古镇规划与保护,提出了自己的一些建议和看法,仅供参考。