东平湖几个鱼类群体遗传多样性的微卫星标记研究

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利用微卫星标记技术,选用27(26)对鲤鱼的微卫星标记引物对东平湖鲤鱼、鲫鱼、麦穗鱼和黄颡鱼进行全基因组扫描,获得了适合以上各种鱼类的微卫星标记位点若干,并利用这些位点对鱼类遗传结构及遗传多样性进行研究,结果如下:1.鲤鱼(选用微山湖鲤鱼及泰安市水产研究所鲤鱼群体作对照研究):有13个微卫星位点在3个鲤鱼群体中均表现出遗传多态性。3个群体的遗传多样性水平均较高,其中SY群体最高,WS群体次之,DP群体最低。根据基因型频率(P)检验了各位点的Hardy-Weinberg平衡情况。Fis值表明3个群体中共有32个微卫星位点的杂合度观测值过剩。3个群体间,WS和SY群体间的遗传相似系数最大(0.8320),遗传距离最小(0.1680),表明这两个群体亲缘关系较近;WS和DP群体间的遗传相似系数最小(0.8288),遗传距离最大(0.1712),表明这两个群体亲缘关系较远。2.鲫鱼(选用微山湖鲫鱼群体作对照研究):有6个微卫星位点在两个鲫鱼群体中均表现出遗传多态性。两个群体共产生38个等位基因,每个位点的等位基因数从1到6个不等。平均观测杂合度(HO)在0.1471和0.9697之间,平均期望杂合度(HE)在0.1422和0.7989之间,大多数位点偏离哈代—温伯格平衡。Fis值表明两个群体内共有6个微卫星位点存在杂合度观测值过剩的现象。两个群体的Shannon信息指数分别为1.3191和1.1332,平均遗传多样性指数为1.3016。位点MFW13的遗传分化系数(Gst)估算值最大,为0.0148,表明该位点在两个鲫鱼群体间的基因分化占总群杂合度的1.48%;其他位点的遗传分化系数值均较小,表明遗传变异主要存在于群体内,群体间遗传变异不大。此外,分析了两个群体间的Nei氏遗传距离。3.麦穗鱼:有13对引物能获得稳定的特异性条带(占总数的50%), 6个微卫星位点具有多态性(占总数的23.1%)。对其中3对引物的扩增产物进行测序分析,发现扩增产物均含有微卫星重复序列,这表明利用鲤鱼的微卫星引物可筛选得到适用于麦穗鱼的微卫星位点。随后,利用这6个微卫星位点分析了麦穗鱼群体的遗传多样性,结果显示:6个位点共检测到22
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