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目的:
生物体利用RNA干扰作为一种天然的抗病毒机制。过去的几年已经发现了在植物病毒、昆虫病毒以及哺乳动物病毒中都存在抵抗RNAi机制的一些蛋白因子。而最新的研究证明了某些病毒可以编码其自身的miRNA或miRNA样分子。此外,宿主编码的miRNA也可以影响宿主细胞内病毒的RNA水平。据此推测包括miRNA在内的RNAi途径和病毒的基因组之间的相互作用可以深刻影响病毒的生活周期及病毒本身的致病性。因此,我们深入研究了可能参与柯萨奇病毒CVB3感染HeLa细胞过程的miRNA,并进一步分析了这些miRNA对病毒与宿主细胞相互作用的影响。
方法:
利用miRNA克隆技术,检测CVB3感染HeLa细胞之后是否诱导新的miRNA产生;应用miRNA芯片技术,检测CVB3感染的HeLa细胞中已知miRNA的表达水平;并在此基础上应用反义寡核苷酸技术及RNAi载体过表达miRNA方法对可能的一些候选miRNA分子进行功能方面的研究。
结果:
1应用miRNA克隆技术从CVB3感染的HeLa细胞中克隆到了一系列小片段的候选miRNA。
2通过Northern印迹及生物信息学方法预测前体分子,最终确定了四个与CVB3感染相关的新的miRNA。
3通过miRNA芯片技术,筛选出CVB3感染的HeLa细胞中差异表达的8个已知miRNA,包括有表达上调的5个miRNA和表达下调的3个miRNA。
4通过对克隆到的CVB3感染相关的新miRNA——miRv-2和miRv-4进行功能研究,发现这两者在一定程度上都可以抑制病毒的感染。
结论:
miRNA克隆可以用于筛选未知的miRNA,而miRNA芯片技术可以用于高通量研究已知miRNA的表达。CVB3感染HeLa细胞之后,不仅使已知的miRNA表达水平发生了变化,而且诱导产生了新的miRNA。同时证明了其中的一些miRNA对病毒的感染具有抑制性作用。