低温冷害是影响水稻产量和地理分布的主要因素之一。在水稻生长发育的不同阶段均有可能遭遇低温冷害的影响,导致水稻产量下降,影响品质。因此,提高水稻的耐寒性和培育耐寒的水稻品种对满足世界人口的粮食需求具有非常重要的意义。本研究以耐冷的粳稻新品系J07-23和籼稻品种IR36杂交衍生的回交重组自交系(BIL)为试验材料,分别在萌发期、芽期和苗期进行耐冷性鉴定,并进行耐冷性相关的QTL定位。主要结果如下:1.利用均匀分布在12条染色体上的450对分子标记在亲本间进行多态性鉴定,共筛选出多态性的分子标记221对。利用Map Chart 2.2结合遗传距离绘制了遗传连锁图谱,覆盖水稻基因组1484.1 cM,平均距离6.72 cM。2.在不同低温条件下,分别在萌发期、芽期和苗期对亲本和BIL群体的耐冷相关指标进行鉴定,发现籼稻亲本IR36在萌发期的耐冷性极显著强于耐冷粳稻亲本J07-23,但是在芽期和苗期的耐冷性极显著弱于J07-23。在处理的3个生长发育时期,BIL群体的耐冷性指标均表现出超亲双向分离现象,并接近于正态连续分布,群体的峰度和偏度的绝对值接近±1,属于典型的数量性状遗传,可进行QTL分析。3.相关性分析表明,在萌发期,低温发芽率与平均发芽天数、发芽系数、发芽指数和日平均发芽率表现为极显著正相关;在苗期,耐冷性评级与死苗率、死叶率表现为极显著正相关,死苗率与干物质重呈极显著负相关,苗长与根长、干物质重表现为极显著正相关。就本研究群体而言,萌发期的发芽率与芽期成苗率没有直接联系,萌发期的发芽率与苗期死苗率表现为显著正相关,芽期成苗率与苗期死苗率呈显著负相关。4.在萌发期,共定位48个与耐冷性相关的QTL,其中主效QTL共7个,贡献率变化范围为15.17~19.75%。检测到控制低温发芽率的QTL共11个,qGR11-2为主效QTL,贡献率为15.96%;定位到控制平均发芽天数的QTL共12个,qAGD1-1为主效QTL,贡献率19.75%;定位到控制发芽系数的QTL共8个,qGC9-1和qGC9-2为主效QTL,贡献率分别为15.86%和15.17%;检测到控制日平均发芽率的QTL共12个,qMDG1-1为主效QTL,贡献率为16.05%;检测到控制发芽指数的QTL共7个,qGI1-2和qGI2-2为主效QTL,贡献率分别为15.78%和15.76%。5.在芽期,定位到控制成苗率的QTL共11个,分别位于第1、2、3、4、7和11染色体上,贡献率变化范围为1.82~17.82%,LOD值变化范围为2.54~6.26。其中,qSR1、qSR2-2和qSR3-4被判定为主效QTL,贡献率分别为15.66%、17.82%和16.95%,qSR1和qSR2-2的增效等位基因来源于耐冷粳稻J07-23,而qSR3-4的增效等位基因来源于籼稻IR36。6.在苗期,检测到控制耐冷性相关的6个指标的QTL共27个。其中,检测到控制耐冷性评级的QTL共2个,qCRL2-1为主效QTL,对表型的贡献率为16.96%;检测到控制死苗率的QTL共8个,qDSR2-2和qDSR11为主效QTL,对表型的贡献率为15.49%和19.33%;检测到控制死叶率的QTL共8个,qDLR2-2是主效QTL,对表型的贡献率为15.57%;检测到控制苗长的QTL共2个,且增效等位基因均来源于籼稻IR36;检测到控制根长的QTL共6个,qRL1是主效QTL,对表型变异的贡献率为21.32%;检测到控制干物质重的QTL仅有qDMW4,对表型变异的贡献率为3.60%,增效等位基因来源于IR36。