作为国家原产地主管机构,海关担负着自贸谈判中原产地规则谈判的筹备启动、原产地规则的制定、通关口岸的原产地监管等重要管理职责。随着经济全球化趋势深入发展、全球产业结构调整步伐加快、区域经济和双边经济合作更加活跃,原产地规则已经从一种纯粹的技术手段发展成为国家实施贸易政策、对外交往战略的重要工具。这增加了原产地问题的复杂性,海关原产地管理也因此面临愈来愈多的风险和挑战。海关在原产地管理上的主导地位却一直不能得到真正有效的体现。因此,迫切需要提高原产地管理水平,有效防范原产地伪报,弥补核查监管在联合行动上的缺失,改善数据交换不足等管理上的缺陷。整体性治理理论主张机关间必须跨越功能过度区分及部门本位主义,通过对话与合作,让机关间的目标、手段及资源充分整合达成一致,以有效解决公众需求。本文经过对原产地管理的政治性、政策性、涉外性、协调性等特点的分析,对海关原产地管理风险和局限性的实证和案例分析,对国外原产地管理经验结合整体性治理理论的研究介绍,引出该理论对原产地管理的指导意义。最后,与整合、协调、信任、制度化、数据库、公共服务、结果导向等整体性治理思想的核心概念融合,提出了海关整合资源、联合相关组织机构共同提高我国的原产地管理水平。