小麦关联RIL群体遗传连锁图谱构建及产量相关性状的QTL定位

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本研究以分别含有229(潍麦8号/烟农19,WY)和485个(潍麦8号/济麦20,WJ)家系的两个关联重组自交系群体(RIL)为材料,利用SSR、EST-SSR、RAPD、SRAP、STS和ISSR等基因组引物构建了两张分子标记遗传连锁图谱。采用完备区间作图法对单株产量及其主要构成因素(每穗小穗数、单株穗数、穗粒数和千粒重)进行了QTL定位分析,并以单株产量分别对单个产量构成因素进行了条件QTL分析,获得以下主要结果:1.利用3123对不同来源的基因组引物对两个RIL群体及其亲本进行多态性筛选,在两个群体中分别有256和237对引物扩增出清晰并有差异的标记位点,并且大多数位点在群体中的分离符合1:1的比例,且为纯合位点。表明两个关联RIL群体可用于小麦数量性状的作图研究。2.运用作图软件MAPMAKER/EXP3.0和Joinmap v3.0,将两个RIL群体的358和344个位点分别定位在小麦的21条染色体上,均形成27个连锁群,构建了两张较高密度的遗传连锁图谱。其中,利用WY群体构建的连锁图谱包含358个位点,全长3010.70 cM,标记间的平均距离为8.41 cM;1B染色体上标记最多,为40个;3D上最少,只有3个。利用WJ群体构建的连锁图谱包含344个位点,全长2855.50 cM,标记间的平均距离为8.30 cM;4A染色体上标记最多,为45个;4D和7D上最少,各有3个。两个关联群体间有69个共有标记,且在连锁图谱中的位置基本一致,这有利于两个群体定位结果的相互比较。3.以两个关联群体的遗传连锁图谱为基础,利用完备区间作图软件IciMapping v3.0对小麦5个重要产量性状(单株穗数、每穗小穗数、穗粒数、千粒重和单株产量)进行了2年4点的QTL定位分析。在WY群体中检测到5个性状的29个加性QTL位点,分布在除3A、3D、4A、5A、5B和7A外的小麦染色体上,单个QTL可解释4.9%?18.6%的性状表型变异;有16个QTL能解释>10%的性状表型变异,为主效QTL;5个QTL能在不同环境中被重复检测到;4个标记区间含有一因多效或紧密连锁的QTL。在WJ群体中检测到5个性状的45个加性QTL位点,分布在除4B外的20条小麦染色体上,单个QTL可解释1.7%?14.7%的性状表型变异;有3个QTL能解释>10%的性状表型变异,为主效QTL;17个QTL能在不同环境中被重复检测到;20个标记区间含有一因多效或紧密连锁的QTL。利用两个群体检测到的5个性状的加性QTL位点分布在小麦21条染色体上,并且有9对QTL在两个群体中与相同的标记连锁,为群体间共表达的QTL。4.在小麦中,首次对单株产量及其构成因素进行了条件QTL分析。在排除了穗粒数、单株穗数和千粒重的变异后,在两个群体单株产量的8/6个非条件QTL和15/17个条件QTL中分别检测到2+2/5+3、1+11/3+11和3+2/5+3个QTL。其中,第一个数字表示被条件分析检测到的非条件QTL的数目,其效应值没有变化或变化很小;第二个数字表示只被条件分析检测到的条件QTL的数目。此外,在WY群体中检测到的4个非条件QTL在条件分析中不能被检测到。条件分析表明,每一个产量QTL可能都至少与一个产量构成要素相关,且不同构成因素对产量QTL的表达影响不同,而以单株穗数对产量的贡献率最大。在两个群体的染色体1B、1D、2A、2D、4A和5A上发现了19个(其中11个来自WY群体)与相同标记连锁的QTL(包括条件QTL),可能是相同的QTL。
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