最近的上海医改已成为公立医院改革的热点话题,华山医院北院、瑞金医院北院、仁济医院南院、第六人民医院东院等4家医院已率先开展取消药品加成政策改革试点,同时合理调整医疗服务项目价格,根据本市医改工作统一部署而作出的破除“以药养医”机制。而公立医院的补偿渠道主要有三种,政府投入、药品加成、医疗服务收费,随着国家对医疗卫生事业的财政投入不断减少,对医疗服务收费采取低成本定价的限价政策,因而公立医院为了维持日常运行、提高服务水平和扩大规模,只得依靠药品加成收入来弥补,随着上海医改的取消药品加成政策的逐步推广,医院资金的日常周转越来越困难。所以补偿机制的改革,对当前进行的医疗卫生体制改革具有深远的意义。本文运用医院管理学的理论,采用理论分析、比较研究、定性分析与定量分析相结合的方法,分析当前公立医院补偿机制现状以及存在的问题,比如以药养医现象严重、财政投入过少等,然后分析了上海目前的补偿机制对公立医院财务管理的影响,主要是取消药品加成后造成收不抵支,总额预付的补偿方式引起资金回收困难,财政补偿不到位造成资金周转困难等几个方面,最后从财政补助的力度、方式和完善医疗服务价格体制等方面提出了解决措施。