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植物根际是微生物生长的特殊微生态环境,根际微生物在种类和数量上往往不同于非根际微生物。越来越多的研究表明,从根际微生态环境中分离得到的许多微生物具有重要生物活性,凶此,植物根际微生物是一类值得深入研究与开发的微生物资源。本研究采用稀有放线菌选择性分离方法,从我国云南及重庆地区采集的60余种我国特有的药用植物的根际土样中分离得到近1000株根际放线菌。根据菌株的形态特征并结合代谢产物的生物活性,挑选了部分分离株进行系统的分类鉴定,包括形态特征和生理生化特性测定、细胞化学组分分析、16S rRNA基因序列相似性比对、基因组DNA G+C mol%和DNA-DNA同源性测定等的多相分类研究。从表型、基因型及系统发育三个层次确定其分类地位。本研究从新分离根际微生物和菌库保藏的菌株中,挑选出9株菌,进行系统的分类研究。菌株105-00074~T被鉴定为糖多孢菌属(Saccharopolyspora)的一个新种,命名为Saccharopolyspora antimicrobica sp.nov.,文章已发表在IJSEM,2008,58,1180-1185;菌株103-09939代表了一个新属—异型束丝放线菌属(Actinoallosynnemagen.nov.),命名为Actinoallosynnema albus sp.nov.,文章已撰写完成;菌株106-02230为放线多形态菌属(Actinopolymorpha)的一个新种,命名为Actinopolymorpha cephalotaxus sp.nov.,文章已撰写完成;菌株106-02658为糖霉菌属(Glycomyces)的一个新种,命名为Glyomyces chongqingensis sp.nov.(文章在整理中);菌株106-03147为动孢囊菌属(Kineosporia)的一个新种,命名为Kineosporia aconitum sp.nov.(文章在整理中)。分离所得1000株根际放线菌菌株经发酵和多种筛选模型的检测,显示出多种生物活性,包括抗G~+细菌,G~-细菌,酵母,丝状真菌及其他生理活性,初筛总阳性率达31%。选取其中具有抑制绿脓杆菌SecA蛋白活性的放线多形态菌属新种I06-02230进行了扩大发酵和活性组分的分离提取,对活性成分2230A进行了初步研究,鉴于该属菌株未有生物活性报道,因此,推测2230A可能为一个新化合物,至少是一个首次从放线多形态菌属菌株代谢产物中分离得到的活性化合物。本研究首次对我国特有的若干药用植物根际放线菌资源开展了选择性分离研究和生物活性研究。所取得的初步研究成果对于充分认识我国药用植物根际微生物资源的多样性有重要意义,也为今后药用植物根际微生物资源的深入开发利用提供了可靠的实验依据。另外,在“新菌”产生“新素”的思想指导下,本论文工作实践了“通过挖掘新种来提高新药筛选的效率和命中率”的筛选策略,并取得初步成效。