基于上调表达候选基因的宫颈癌早期预警指标研究

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目的:早期发现是宫颈癌治疗的关键,而筛选肿瘤分子标志物是建立肿瘤早期诊断方法的有效途径。本课题拟利用人类全基因组表达谱芯片,通过维吾尔族妇女宫癌的转录组学研究,筛选上调表达候选基因,并进一步检测特定候选基因的特异性和灵敏度,评价转录组学分析结果的可靠性和准确度,并建立宫颈癌的早期预警指标。方法:(1)收集维吾尔族妇女宫颈病变组织72例,其中宫颈鳞癌(cervical squamous cell carcinoma,CSCC)25 例,宫颈内上皮瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)Ⅱ-Ⅲ 22 例和宫颈炎或正常宫颈(normal cervix,NC)组织 25 例,提取组织总RNA;(2)选取高质量组织RNA 20例(CSCC 7例,CINⅡ-Ⅲ 7例,NC 6例),通过宫颈病变组织RNA的人类全基因组表达谱芯片分析,筛选宫颈癌特异性上调表达基因;(3)选择3种宫颈癌特异性上调表达候选基因,设计mRNA序列特异性引物,对宫颈病变组织RNA进行半定量及荧光定量RT-PCR筛查分析,检测上调表达候选基因的特异性和灵敏度分析,评价基因芯片分析结果的可靠性和准确度。结果:(1)宫颈病变组织总RNA的人类全基因组表达谱芯片分析,以大于2倍的基因转录表达水平差异为量化标准,CSCC与NC 比较,有上调表达基因394种,CSCC与CINⅡ-Ⅲ比较,有上调表达基因516种,但是CINⅡ-Ⅲ与NC之间没有上调表达基因。(2)选取SIX1、DTL和APOBEC3B等三种上调表达候选基因,通过宫颈病变组织RNA的半定量RT-PCR筛查分析,发现三种基因的mRNA表达水平在CSCC与Ⅱ-Ⅲ或NC组织之间均有显著差异(P<0.05),但是在Ⅱ-Ⅲ和NC组织之间的差异无统计学意义(P>0.05)。(3)利用荧光定量RT-PCR方法,进一步检测三种基因的转录表达水平,发现SIX1和DTL基因的mRNA表达水平在 CSCC 组织最高(0.891±0.517 和 0.026±0.021),在 CINⅡ-Ⅲ组织(0.534±0.290和 0.015±0.007)降低,在 NC 组中最低(0.035±0.032 和 0.003±0.003),除了 DTL基因表达水平在CSCC与CIN组织之间无差异(P>0.05)以外,其余两两比较均有差异,并有统计学意义(P<0.05),但是APOBEC3B基因表达水平在CSCC、CIN和NC之间均没有统计学差异(P>0.05),进一步进行SIX1和DTL基因的特异度、灵敏度和准确度分析,发现这两种基因的特异度和灵敏度分别为(42.6%、95.7%、54%)和(21.7%、96.0%、38.9%),分析这两种宫颈癌特异性候选基因的相关性,发现,SIX1与DTL呈中度正相关(r=0,490、P=0.000)。结论:维吾尔族妇女宫颈癌的发生发展与多种基因的上调表达关系密切。SIX1和DTL基因表达调控可能是宫颈癌发生的重要标志,其中DTL有较高的早期预警价值,此也证明了转录组学筛查数据的可靠性和准确度。
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