合伙企业作为一个较为新兴的商事主体,在我国经济活动中扮演着越来越重要的角色,而合伙企业所得税问题在合伙企业中国范畴是无可避免的一个大问题。不像《个人所得税法》和《企业所得税法》,有自己的专门的基本法进行规定,合伙企业所得税主要依靠部颁税法规则进行指导,本文就是基于部颁税法规则对合伙企业所得税问题进行研究。本文首先介绍了我国合伙企业所得税法制的变迁。合伙企业所得税的征税有两个历史阶段,即从双重征税阶段到适用穿透原则的阶段,合伙企业所得税法律规则目前处于尚不完备的状态,目前的税法规则在对《合伙企业法》部分承认时也存在与之的隐形冲突。为了规制合伙企业各种经济行为的纳税,我国出台了一系列部颁税法规则对纳税规则进行了细化,解决了实践中不少争议;然而,这些细化的部颁税法规则也可能引致冲突。结合部颁规则以及所得税纳税结构的分析,可以发现以下几个问题:合伙企业的同一经济行为适用不同的税目问题、合伙企业所得税“穿透”原则贯彻不彻底以及合伙企业所得税反避税制度不完备这三个问题。并且从上述问题中分别并选取了典型问题,即合伙企业份额转让涉税问题、我国合伙企业股息红利涉税问题、我国合伙企业所得税反避税问题,在后文并对它们进行法理和现实适用的分析,最终给出完善的路径。本文接着分析了合伙企业份额转让涉税的法理问题,依据所得税四元结构分析合伙企业份额转让的纳税主体及客体,同时引入“要素报酬说”和“黑格-西蒙斯准则”对税目范围的确定进行探讨。针对合伙企业份额转让所得税的现实争议,即纳税客体和税基问题进行归纳总结,最后提出完善建议。本文同时也合伙企业股息红利所得税问题也展开了研究,合伙企业股息红利所得的法理问题集中在纳税主体和纳税客体以及税收优惠涉及的税基问题。在现实中,法人合伙人不能获得所得性质的传递以及创投企业与其他合伙企业适用税率的依据不同,都是合伙企业“税收透明体”贯彻不彻底的表现,从而影响税收公平。针对以上问题,提出了完善建议。本文最后对于合伙企业所得税反避税问题进行了探讨,合伙企业的所得大多具有可税性,然而现实中存在合伙企业利用税法规则的漏洞,将关联交易以及合伙协议的拟定作为避税手段,这就对税务机关的征管造成困难。因此有必要借鉴国外经验,明确关联交易的定性、规范以避税为目的的合伙协议,并且建立具体针对合伙企业的避税规则。