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杓兰系兰科,杓兰亚科多年生草本植物,是一种重要的野生濒危植物,有着重要的观赏及药用价值。我国是全世界杓兰属植物的资源多样性中心。根据其主要形态的差异,杓兰属植物共分为12个组及2个亚组,但由于形态形状易受环境因素的影响,整个杓兰亚科及属间的分类地位及系统发育关系仍存在一些争议区域。为此,需采用其他方法对其相关研究进行补充和完善。本研究选取了四川省西南部山区10个种杓兰及杓兰亚科其余四个属部分具代表性的种作为样本,以nrDNA的ITS及cpDNA的trnH-psbA核苷酸序列为试验对象,试图从分子生物学角度为杓兰亚科及杓兰属植物系统发育研究提供分子生物学依据。主要试验结果如下：1.ITS及trnH-psbA在杓兰属植物中PCR扩增效果良好,容易获得。杓兰属植物ITS序列长度为678bp左右,种间长度差异不大,不存在假基因序列；trnH-psbA序列长度为1014bp左右,不同种间长度差异明显,且该序列中存在一个长度严格为279bp的rps19编码基因。2.基于ITS序列信息的属间系统发育研究表明：杓兰亚科5个属分类界限明显。具对折叶的墨国兜兰属、美洲兜兰属及兜兰属为近缘属,其中墨国兜兰属与美洲兜兰属亲缘关系更近；具折扇状叶的杓兰属与碗兰属在整个亚科中的进化地位独立。3.基于ITS序列信息的杓兰属种间系统发育研究表明：墨西哥杓兰在所研究的杓兰类群中进化地位独立,并没有和暖地杓兰及宽口杓兰聚为一类。此外,ITS序列信息还显示麻栗坡兜独立于杓兰属植物之外,二者并没有较近的亲缘关系。4.结合ITS及trnH-psbA序列信息,在川西南杓兰品种中,丽江杓兰与毛瓣杓兰有着紧密的亲缘关系。绿花杓兰、西藏杓兰、云南杓兰、毛杓兰及大叶杓兰亲缘关系密切,黄花杓兰、紫点杓兰及离萼杓兰在川西南杓兰中进化地位较为独立,与Cribb(1997,1998)的形态学研究成果相近。但对于杓兰组的种间亲缘关系,ITS与trnH-psbA序列信息均支持杓兰亚组的大叶杓兰与大花亚组的杓兰亲缘关系较近,建议重新考虑大叶杓兰的分组地位。当然,本研究所涉及类群不够全面,可能会影响种间亲缘关系的支持率。5.ITS及trnH-psbA两个DNA条形码在杓兰属,种间有着较强的识别能力。trnH-psbA序列中存在大量的插入／缺失现象,使其在处理某些近缘种的亲缘关系上存在一定的局限性,但它对于杓兰属植物来说有着重要的进化意义。